More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1176 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 311 aa  637    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  96.14 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  93.89 
 
 		 317 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.84 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 315 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 309 aa  312  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 338 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 		 318 aa  308  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  51.45 
 
 		 313 aa  306  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 316 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 		 314 aa  301  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 301 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  51.46 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 		 313 aa  298  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 		 316 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 309 aa  295  6e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 318 aa  295  7e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 		 316 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 		 316 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 		 316 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 316 aa  292  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 316 aa  291  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  48.08 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 		 316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 305 aa  288  6e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 		 304 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  50.82 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  52.24 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 		 298 aa  281  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 312 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 		 300 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  48.12 
 
 		 318 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 		 303 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  46.25 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 		 302 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  44.71 
 
 		 296 aa  275  9e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  42.43 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 		 312 aa  272  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 		 308 aa  271  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>