More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2611 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  70 
 
 
296 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  68.24 
 
 
309 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  68.47 
 
 
297 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 
323 aa  388  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 
309 aa  323  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 
302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  51.68 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  52.51 
 
 
303 aa  301  8.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 
309 aa  298  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
314 aa  298  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  52.9 
 
 
305 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
309 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
302 aa  292  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  292  5e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 
318 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 
355 aa  291  8e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
317 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 
302 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
305 aa  290  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
311 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 
311 aa  289  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
303 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 
303 aa  289  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
316 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.65 
 
 
301 aa  288  8e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
316 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
316 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
316 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
316 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
316 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
316 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
318 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 
306 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
316 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
316 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
304 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  46 
 
 
318 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51.36 
 
 
298 aa  285  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
303 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  49.66 
 
 
298 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  47.97 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
300 aa  281  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 
316 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
306 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
306 aa  279  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
305 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
301 aa  277  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
320 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
304 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
321 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 
313 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  52.17 
 
 
312 aa  276  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
305 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
305 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
313 aa  275  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
318 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 
308 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  47.65 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  51.68 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14481  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 
307 aa  273  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 
312 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
304 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
312 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 
304 aa  272  5.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
300 aa  271  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
312 aa  271  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
309 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
312 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 
303 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
305 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14241  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
308 aa  268  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.256907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
305 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 
308 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
304 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
309 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
309 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  43.96 
 
 
304 aa  267  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>