More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5467 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  70.36 
 
 
315 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  69.71 
 
 
311 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  67.74 
 
 
310 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  69.81 
 
 
322 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  65.25 
 
 
321 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  64.84 
 
 
335 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  66.01 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  70.83 
 
 
314 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  67.97 
 
 
306 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  68.95 
 
 
319 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  64.31 
 
 
330 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  64.61 
 
 
310 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  64.19 
 
 
310 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  63.87 
 
 
333 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  63.84 
 
 
307 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  61.76 
 
 
307 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  61.76 
 
 
307 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  61.44 
 
 
307 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  63.37 
 
 
310 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  61.89 
 
 
323 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  61.44 
 
 
306 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  60.9 
 
 
327 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  61.31 
 
 
307 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 
308 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  62.21 
 
 
309 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  62.05 
 
 
312 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  58.96 
 
 
307 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
314 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  62.82 
 
 
312 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  60.46 
 
 
340 aa  359  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  58.31 
 
 
307 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  60.39 
 
 
321 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  58.12 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  58.63 
 
 
312 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  59.61 
 
 
319 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 
309 aa  316  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 
307 aa  308  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.86 
 
 
305 aa  299  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
311 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
311 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
305 aa  295  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  295  8e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
304 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
315 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.14 
 
 
305 aa  289  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 
308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  288  8e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  52.69 
 
 
309 aa  286  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
300 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
312 aa  285  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
303 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  48.72 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 
320 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
306 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
303 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 
303 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
301 aa  278  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
312 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47.57 
 
 
303 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
298 aa  275  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  46.64 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 
306 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
305 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
303 aa  272  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
326 aa  271  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  47.76 
 
 
304 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
313 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
313 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 
308 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
313 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
314 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
305 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
307 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
313 aa  269  4e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  48.24 
 
 
313 aa  269  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
303 aa  269  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
309 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
309 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
332 aa  268  8e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
309 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
309 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
309 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>