More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1334 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
335 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1073  ornithine carbamoyltransferase  79.82 
 
 
344 aa  565  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  79.51 
 
 
330 aa  544  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1248  ornithine carbamoyltransferase  75.91 
 
 
338 aa  519  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  74.47 
 
 
334 aa  518  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  72.84 
 
 
338 aa  518  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  74.62 
 
 
338 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 
309 aa  298  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
303 aa  295  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 
303 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 
303 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 
305 aa  288  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  46.5 
 
 
313 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
303 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.08 
 
 
314 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
301 aa  287  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  46.3 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.78 
 
 
306 aa  281  8.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 
302 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
309 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
305 aa  279  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
312 aa  279  6e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 
312 aa  278  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
313 aa  278  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 
303 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
309 aa  276  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  49.82 
 
 
312 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
303 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  44.98 
 
 
315 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 
317 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  43.99 
 
 
323 aa  269  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  44.94 
 
 
317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  44.75 
 
 
307 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  44.16 
 
 
309 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  43.67 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  43.35 
 
 
316 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  45.19 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.35 
 
 
316 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  43.59 
 
 
316 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.35 
 
 
316 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
311 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
305 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.04 
 
 
316 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 
319 aa  262  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.96 
 
 
300 aa  262  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.04 
 
 
316 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.04 
 
 
316 aa  262  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
304 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
309 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  44.05 
 
 
304 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 
313 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 
298 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  43.53 
 
 
306 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  42.99 
 
 
316 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  41.03 
 
 
304 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  43.91 
 
 
314 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
329 aa  259  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  43.99 
 
 
320 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
355 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  47.29 
 
 
300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  43.41 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
304 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  42.41 
 
 
316 aa  258  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
305 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
302 aa  258  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
305 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
313 aa  258  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 
302 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 
306 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 
329 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  44.63 
 
 
326 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  43.62 
 
 
305 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
305 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 
309 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
309 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  43.59 
 
 
313 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 
306 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  44.7 
 
 
308 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
311 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  44.84 
 
 
309 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  44.84 
 
 
309 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  44.23 
 
 
305 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
298 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 
301 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  43.09 
 
 
305 aa  256  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  44.63 
 
 
302 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  41.93 
 
 
317 aa  255  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  42.27 
 
 
311 aa  255  7e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
308 aa  255  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  40.91 
 
 
305 aa  255  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  41.88 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  46.57 
 
 
307 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  44.84 
 
 
309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  42.02 
 
 
303 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  42.21 
 
 
313 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>