More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2837 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  75.08 
 
 
307 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  75.58 
 
 
307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  75.58 
 
 
307 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  75.58 
 
 
307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  75.74 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  75.41 
 
 
307 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  69.64 
 
 
310 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  69.71 
 
 
309 aa  431  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  69.77 
 
 
312 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  66.23 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  66.01 
 
 
311 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  64.8 
 
 
323 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  66.78 
 
 
322 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  62.71 
 
 
338 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  61.78 
 
 
327 aa  384  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  66.23 
 
 
321 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  61.31 
 
 
308 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  64.86 
 
 
314 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  58.58 
 
 
310 aa  371  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  61.92 
 
 
306 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  58.96 
 
 
308 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 
306 aa  354  8.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  58.71 
 
 
330 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  58.77 
 
 
310 aa  351  7e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  59.03 
 
 
310 aa  345  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 
335 aa  344  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  56.45 
 
 
333 aa  342  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  60.93 
 
 
319 aa  340  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 
321 aa  335  5.999999999999999e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 
312 aa  334  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  58.42 
 
 
319 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 
340 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  57.52 
 
 
314 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  55.37 
 
 
317 aa  315  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
315 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 
309 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
314 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
309 aa  293  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 
313 aa  292  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  49.15 
 
 
306 aa  291  7e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
302 aa  288  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
323 aa  287  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
307 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
313 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.19 
 
 
305 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
304 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
300 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 
303 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
316 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
305 aa  281  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
316 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
316 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
308 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  47.88 
 
 
305 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
316 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
311 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
311 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 
309 aa  280  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
316 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
316 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
312 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 
320 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 
316 aa  279  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
303 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  44.16 
 
 
303 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
304 aa  278  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
316 aa  278  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
316 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 
309 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
305 aa  278  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
306 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
302 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
298 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
312 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 
302 aa  276  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  46.95 
 
 
312 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  48.06 
 
 
311 aa  275  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
307 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
323 aa  275  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
305 aa  275  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  46.65 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
307 aa  273  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 
318 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>