More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1248 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1248  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 338 aa  693    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  82.62 
 
 		 338 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  80.12 
 
 		 338 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  80.55 
 
 		 334 aa  558  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  80.85 
 
 		 330 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1073  ornithine carbamoyltransferase  78.05 
 
 		 344 aa  536  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  75.91 
 
 		 335 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 		 312 aa  328  7e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 303 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.95 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 		 305 aa  292  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  47.42 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 306 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.81 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.69 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 		 303 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 		 329 aa  275  9e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 		 303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.37 
 
 		 305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  45.89 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  50.37 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  44.94 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.41 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 		 316 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.56 
 
 		 300 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.41 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  46.25 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 309 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  45.91 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  46.25 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  45.81 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 298 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  45.05 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  44.73 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  42.26 
 
 		 304 aa  265  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  43.99 
 
 		 355 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  43 
 
 		 309 aa  265  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 		 305 aa  265  7e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  45.34 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  42.43 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  49.28 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 		 312 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  49.62 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 		 308 aa  262  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  44.23 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  44.34 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  42.68 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>