More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0193 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  85.71 
 
 		 301 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  85.38 
 
 		 301 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  85.05 
 
 		 301 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  85.38 
 
 		 301 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  83.06 
 
 		 301 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  82.39 
 
 		 301 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  82.06 
 
 		 301 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  82.06 
 
 		 301 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  81.73 
 
 		 301 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0204  ornithine carbamoyltransferase  78.74 
 
 		 301 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  79.33 
 
 		 302 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  79 
 
 		 302 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  79.4 
 
 		 301 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  78 
 
 		 301 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0229  ornithine carbamoyltransferase  77.41 
 
 		 301 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0230  ornithine carbamoyltransferase  58.8 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000828379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  60.73 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0980  ornithine carbamoyltransferase  58.59 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00530  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 303 aa  342  5e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 		 313 aa  291  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 		 323 aa  289  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  47.13 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  46 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 		 316 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 		 316 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 		 307 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  45.33 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 304 aa  265  5e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  45 
 
 		 316 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  45 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  46.8 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  47.78 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  44.67 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 		 305 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 		 305 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 		 305 aa  255  5e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  43.96 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 		 304 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  40.86 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  43.09 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  42.38 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  43.05 
 
 		 323 aa  248  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  41.12 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 330 aa  246  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 		 312 aa  245  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 		 312 aa  245  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  40.13 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  42.3 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  43.52 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1073  ornithine carbamoyltransferase  42.02 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  43.52 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  42.38 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 		 338 aa  241  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  42.38 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  39.02 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  42.35 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  43 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  42.57 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  42.19 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>