More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1115 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
310 aa  637    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  67.86 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  65.81 
 
 
315 aa  427  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  64.74 
 
 
330 aa  425  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  67.74 
 
 
308 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  65.05 
 
 
310 aa  421  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  68.18 
 
 
306 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  68.61 
 
 
314 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  63.9 
 
 
327 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  62.26 
 
 
310 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  64.31 
 
 
311 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  66.99 
 
 
322 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  66.01 
 
 
338 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  65.3 
 
 
314 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  61.36 
 
 
307 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  65.58 
 
 
319 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  61.04 
 
 
307 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  61.04 
 
 
307 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  59.35 
 
 
307 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  59.03 
 
 
323 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  61.34 
 
 
335 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  58.58 
 
 
307 aa  371  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  60.9 
 
 
312 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  61.02 
 
 
333 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  59.55 
 
 
310 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  59.35 
 
 
307 aa  362  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  57.78 
 
 
309 aa  360  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  56.17 
 
 
306 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  56.13 
 
 
307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  56.72 
 
 
312 aa  345  8e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  58.71 
 
 
321 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  56.54 
 
 
308 aa  342  5.999999999999999e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 
312 aa  332  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  54.34 
 
 
340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  53.7 
 
 
317 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  56.49 
 
 
319 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
314 aa  305  6e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 
305 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  51.47 
 
 
312 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.06 
 
 
307 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52.36 
 
 
315 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.27 
 
 
306 aa  293  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  48.47 
 
 
305 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 
302 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.91 
 
 
355 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
301 aa  288  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  53.21 
 
 
312 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 
304 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 
308 aa  285  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  44.34 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  46.62 
 
 
303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  52.5 
 
 
312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
314 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 
314 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 
300 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  45.81 
 
 
303 aa  280  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  52.14 
 
 
312 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  47.45 
 
 
312 aa  280  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 
313 aa  279  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 
312 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  42.77 
 
 
306 aa  277  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
316 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  46.79 
 
 
309 aa  276  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  45.63 
 
 
303 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 
319 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  47.6 
 
 
316 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
302 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
304 aa  276  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 
316 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
316 aa  275  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  47.6 
 
 
330 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  48.4 
 
 
316 aa  275  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
316 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
298 aa  275  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.81 
 
 
316 aa  275  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 
313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  46.45 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  47.45 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  48.24 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 
308 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
306 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 
318 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  44.81 
 
 
316 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  47.27 
 
 
309 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  46.47 
 
 
305 aa  271  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  48.4 
 
 
304 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>