More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2027 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
322 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  75.95 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  76.55 
 
 
311 aa  471  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  70.68 
 
 
315 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  68.15 
 
 
327 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  69.81 
 
 
308 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  66.99 
 
 
310 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  65.91 
 
 
323 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  66.78 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  67.43 
 
 
306 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  64.17 
 
 
307 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  63.24 
 
 
330 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  69.58 
 
 
314 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  64.19 
 
 
310 aa  387  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  64.08 
 
 
309 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  63.46 
 
 
307 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  63.46 
 
 
307 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  63.46 
 
 
307 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  64.29 
 
 
307 aa  381  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  63.06 
 
 
312 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  64.61 
 
 
310 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
321 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  63.52 
 
 
307 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  65.3 
 
 
319 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  62.62 
 
 
310 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  60.65 
 
 
321 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  60.46 
 
 
308 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  59.94 
 
 
335 aa  371  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  63.14 
 
 
312 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  64.97 
 
 
314 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  60.59 
 
 
306 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  59.49 
 
 
333 aa  360  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  62.5 
 
 
312 aa  358  5e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 
340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  62.46 
 
 
319 aa  355  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  59.93 
 
 
317 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  51.3 
 
 
307 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  51.42 
 
 
315 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 
305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.14 
 
 
312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 
314 aa  305  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 
302 aa  305  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 
309 aa  305  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  48.59 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  52.6 
 
 
309 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  52.6 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
320 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
311 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
311 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  52.6 
 
 
304 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  54.72 
 
 
312 aa  298  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  51.69 
 
 
309 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  47.98 
 
 
311 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  51.53 
 
 
306 aa  296  3e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 
307 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  50.95 
 
 
323 aa  295  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
316 aa  295  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
316 aa  295  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
316 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.3 
 
 
300 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
316 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
305 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
316 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
306 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  51.61 
 
 
313 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 
311 aa  292  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
316 aa  292  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
316 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
316 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
301 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
316 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 
308 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  47.45 
 
 
309 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
306 aa  289  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
305 aa  288  6e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  51.62 
 
 
308 aa  288  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  47.76 
 
 
309 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.52 
 
 
304 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
304 aa  288  8e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
313 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
305 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  45.63 
 
 
304 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  47.44 
 
 
302 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  45.02 
 
 
316 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
306 aa  286  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 
310 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 
309 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
312 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
298 aa  285  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 
301 aa  285  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
303 aa  285  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  46.79 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  49.21 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>