More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
327 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  71.38 
 
 
311 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  68.15 
 
 
322 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  65.51 
 
 
315 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  65.29 
 
 
330 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  64.94 
 
 
321 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  63.9 
 
 
310 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  64.72 
 
 
338 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  64.33 
 
 
310 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  66.34 
 
 
306 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  61.98 
 
 
310 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  62.06 
 
 
323 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  61.78 
 
 
307 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  60.9 
 
 
308 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  65.7 
 
 
314 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  60.9 
 
 
307 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  63.12 
 
 
314 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  63.75 
 
 
319 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  60 
 
 
307 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  60.32 
 
 
307 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  60.32 
 
 
307 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  58.65 
 
 
307 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  60.06 
 
 
312 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  61.09 
 
 
321 aa  361  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  59.16 
 
 
310 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  59.29 
 
 
307 aa  359  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  59.42 
 
 
309 aa  358  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 
308 aa  345  6e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  55.77 
 
 
306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  53.97 
 
 
312 aa  329  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  53.99 
 
 
335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  53.35 
 
 
333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 
312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  56.31 
 
 
319 aa  322  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  54.31 
 
 
340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
315 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
309 aa  292  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.19 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 
311 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 
311 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  48.14 
 
 
305 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  42.17 
 
 
304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  48.4 
 
 
312 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.08 
 
 
304 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  45.66 
 
 
320 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  47.6 
 
 
305 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 
300 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  45.83 
 
 
309 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  44.23 
 
 
305 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 
306 aa  276  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  46.45 
 
 
298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 
305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  47.57 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  49.06 
 
 
313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.75 
 
 
313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  50.8 
 
 
312 aa  272  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  48.08 
 
 
300 aa  271  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  42.63 
 
 
306 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
301 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  46.65 
 
 
303 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  45.86 
 
 
303 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  44.09 
 
 
303 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  45.34 
 
 
314 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  44.23 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  46.39 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  42.63 
 
 
307 aa  270  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  44.09 
 
 
303 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  47.77 
 
 
302 aa  268  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 
308 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  43.91 
 
 
306 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  45.22 
 
 
303 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
320 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  46.47 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 
307 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  44.23 
 
 
308 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
298 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  46.52 
 
 
312 aa  266  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  42.99 
 
 
316 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  44.27 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  45.94 
 
 
312 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  42.81 
 
 
307 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  42.36 
 
 
316 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  42.68 
 
 
316 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  44.09 
 
 
306 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  46.65 
 
 
304 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
303 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 
312 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  41.72 
 
 
316 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  42.36 
 
 
316 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  41.72 
 
 
316 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
303 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
303 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 
304 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  47.28 
 
 
309 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  47.95 
 
 
314 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 
306 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  45.71 
 
 
309 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>