More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1645 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
310 aa  613  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  72.73 
 
 
310 aa  435  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  75.4 
 
 
314 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  72.44 
 
 
330 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  62.26 
 
 
310 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  67.1 
 
 
315 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  65.48 
 
 
311 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  64.19 
 
 
308 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  61.98 
 
 
327 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  60.2 
 
 
321 aa  378  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  63.64 
 
 
306 aa  371  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
306 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  62.62 
 
 
322 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  63.41 
 
 
314 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  62.54 
 
 
323 aa  363  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  60 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  58.77 
 
 
308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  58.77 
 
 
307 aa  351  8.999999999999999e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  59.42 
 
 
307 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  59.42 
 
 
307 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  59.42 
 
 
307 aa  348  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  59.68 
 
 
307 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  59.03 
 
 
307 aa  345  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  59.03 
 
 
307 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  61.94 
 
 
321 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  61.36 
 
 
319 aa  335  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  55.27 
 
 
335 aa  332  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  59.15 
 
 
310 aa  330  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  54.95 
 
 
333 aa  328  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  57.56 
 
 
309 aa  328  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 
312 aa  325  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  56.41 
 
 
312 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  57.47 
 
 
312 aa  316  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  54.05 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  53.53 
 
 
317 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  53.55 
 
 
319 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  41.75 
 
 
304 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 
315 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
309 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  45.65 
 
 
305 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 
307 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 
314 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  43.18 
 
 
312 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
323 aa  255  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  44.11 
 
 
306 aa  253  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
306 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  40.58 
 
 
316 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 
313 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  42.81 
 
 
308 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  44.34 
 
 
309 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  40.13 
 
 
309 aa  250  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  39.61 
 
 
316 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  43.41 
 
 
303 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 
316 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  40.52 
 
 
316 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  40.07 
 
 
316 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 
316 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 
316 aa  248  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 
316 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 
316 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
309 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
305 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 
355 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  40.58 
 
 
320 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 
312 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  45.81 
 
 
309 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  43.37 
 
 
311 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  45.81 
 
 
305 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  38.96 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  42.39 
 
 
305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  43.55 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 
316 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  42.58 
 
 
303 aa  245  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
338 aa  245  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  44.16 
 
 
306 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  41.61 
 
 
303 aa  244  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  43.04 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  47.25 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 
313 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  41.61 
 
 
303 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  44.69 
 
 
308 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  42.77 
 
 
320 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
309 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
312 aa  242  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  43.37 
 
 
305 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  45.49 
 
 
312 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
309 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 
312 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  44.16 
 
 
306 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
306 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  38.96 
 
 
302 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  41.69 
 
 
313 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>