More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3066 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
319 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  63.34 
 
 
323 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  63.28 
 
 
338 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  64.52 
 
 
321 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  61.72 
 
 
310 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  62.46 
 
 
322 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  59.93 
 
 
311 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  58.42 
 
 
307 aa  352  5e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  58.17 
 
 
307 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  58.17 
 
 
307 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  59.61 
 
 
308 aa  349  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  57.84 
 
 
307 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  58.17 
 
 
307 aa  342  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  56.31 
 
 
327 aa  342  5e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  59.08 
 
 
309 aa  341  8e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  58.42 
 
 
312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  56.49 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 
315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 
307 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 
310 aa  332  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  55.74 
 
 
307 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  53.77 
 
 
321 aa  322  5e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  55.74 
 
 
306 aa  322  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 
340 aa  322  7e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  54.19 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  57.74 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  58.09 
 
 
312 aa  319  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  56.96 
 
 
314 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  55.88 
 
 
319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  56.21 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 
304 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  53.55 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
306 aa  300  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 
335 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  56.72 
 
 
314 aa  299  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  52.61 
 
 
333 aa  299  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 
309 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
308 aa  287  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
314 aa  287  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  55.02 
 
 
309 aa  286  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
309 aa  285  9e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  54.81 
 
 
304 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
306 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.74 
 
 
308 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
308 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 
311 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 
311 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
305 aa  277  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  51.88 
 
 
306 aa  275  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
312 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  45 
 
 
316 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  49.3 
 
 
306 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  45.33 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  45.33 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  45.33 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  45.33 
 
 
316 aa  272  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
307 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.13 
 
 
304 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
309 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  45 
 
 
316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  50.57 
 
 
309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.4 
 
 
313 aa  268  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  50.57 
 
 
309 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 
302 aa  267  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  44.33 
 
 
316 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.19 
 
 
355 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 
305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
316 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
316 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  49.66 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
301 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
308 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  51.44 
 
 
308 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
310 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1482  ornithine carbamoyltransferase  52.04 
 
 
318 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.278648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  44.33 
 
 
316 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  51.28 
 
 
328 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  47.74 
 
 
303 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 
331 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
316 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
309 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
330 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  51.65 
 
 
309 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.92 
 
 
303 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  47.69 
 
 
313 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
300 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
314 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  48.08 
 
 
313 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  48.89 
 
 
306 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  43.62 
 
 
318 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>