More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0229 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0229  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  84 
 
 		 302 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  84.67 
 
 		 302 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0204  ornithine carbamoyltransferase  83.72 
 
 		 301 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  80.07 
 
 		 301 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  80.4 
 
 		 301 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  80.4 
 
 		 301 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  79.4 
 
 		 301 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  79.73 
 
 		 301 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 301 aa  497  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 301 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  77.41 
 
 		 301 aa  494  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  78.74 
 
 		 301 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  77.41 
 
 		 301 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  76.33 
 
 		 301 aa  480  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  73.75 
 
 		 301 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0230  ornithine carbamoyltransferase  58.47 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000828379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0980  ornithine carbamoyltransferase  59.53 
 
 		 305 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  60.4 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00530  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 338 aa  311  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.55 
 
 		 313 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  46.95 
 
 		 313 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 312 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 316 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 316 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  44.7 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  41.86 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.52 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.52 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 304 aa  255  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 305 aa  255  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  41.91 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 		 317 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 		 312 aa  246  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  42.52 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 		 317 aa  244  9e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  41.42 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  41.56 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 		 323 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  41.67 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  40.79 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  41.25 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  42.67 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  38.54 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  41.45 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  41.25 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  41.2 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  40.33 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  39.8 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  40.79 
 
 		 312 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  41.64 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  44.34 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  38.61 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  39.33 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14481  ornithine carbamoyltransferase  41.2 
 
 		 308 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  42.02 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  40.92 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>