More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0980 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0980  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 305 aa  631  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00530  ornithine carbamoyltransferase  67.44 
 
 		 303 aa  440  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  60.4 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 		 301 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0204  ornithine carbamoyltransferase  60.61 
 
 		 301 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  58.59 
 
 		 301 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0229  ornithine carbamoyltransferase  59.53 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  59.67 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 		 301 aa  364  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 301 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 		 301 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  57.19 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  59.53 
 
 		 301 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0230  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 302 aa  349  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000828379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  54.14 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 		 323 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  45.69 
 
 		 313 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  46.01 
 
 		 313 aa  268  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 305 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 		 340 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  44.97 
 
 		 317 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  40.98 
 
 		 303 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  42.35 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  41.58 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  41.39 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  40.2 
 
 		 316 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  41.58 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  40.4 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1073  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  40.72 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  40.79 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  39.87 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  40.52 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  39.87 
 
 		 316 aa  235  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  39.87 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  41.12 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  40.2 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  41.06 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  41.06 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  40.59 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  39.53 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  39.8 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  39.53 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  42.38 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  39.53 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  42.38 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  40.73 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  40.75 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  42.38 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  42.38 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  39.67 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  39.53 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  41.06 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  39.53 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  40.4 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1605  ornithine carbamoyltransferase  39.07 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.416404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  40.98 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  41.31 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  40.26 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  38.69 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  39.87 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  41.12 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  39.74 
 
 		 355 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  38.94 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  39.4 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  37.34 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  39.4 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  41.78 
 
 		 317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  40.13 
 
 		 315 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0558  ornithine carbamoyltransferase  40.53 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  37.95 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  41.56 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  36.81 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  38.54 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  41.36 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  42.7 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0534  ornithine carbamoyltransferase  39.87 
 
 		 371 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  37.09 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  38.16 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  41.75 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  39.93 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  39.6 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  36.3 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  37.58 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  40.53 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  36.96 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  39.67 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  39.14 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  36.39 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  39.14 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>