More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1605 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1605  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.416404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  69.41 
 
 
313 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  70.07 
 
 
313 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  48.4 
 
 
313 aa  278  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
317 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
309 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  48.23 
 
 
309 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 
305 aa  269  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
309 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
338 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 
309 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
305 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
300 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 
323 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
313 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
311 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 
303 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
311 aa  263  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  46.79 
 
 
313 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
317 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
303 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
313 aa  262  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
306 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
321 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
304 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 
303 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
306 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 
301 aa  255  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
309 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 
306 aa  253  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
307 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
303 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
312 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  46.62 
 
 
309 aa  251  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
318 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
311 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
311 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  43.29 
 
 
301 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  41.78 
 
 
302 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  42.3 
 
 
306 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
318 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
305 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
306 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
307 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 
306 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 
320 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  44.34 
 
 
312 aa  248  7e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
308 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
318 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 
309 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 
340 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
302 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  47.62 
 
 
297 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
305 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
304 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  43.88 
 
 
305 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
312 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 
304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  45.61 
 
 
309 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  44.78 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  44.85 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 
323 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
299 aa  242  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 
318 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  42.3 
 
 
308 aa  242  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 
332 aa  241  7.999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  42 
 
 
313 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  44.9 
 
 
298 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  45.3 
 
 
312 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  43.54 
 
 
328 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
303 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  43.33 
 
 
305 aa  240  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  41.67 
 
 
338 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 
303 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
312 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  42.19 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  42.81 
 
 
304 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  43.33 
 
 
304 aa  239  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  40.67 
 
 
302 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  41.22 
 
 
301 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  41.42 
 
 
334 aa  238  9e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  44.67 
 
 
304 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  41.91 
 
 
308 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>