More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00530 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00530  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0980  ornithine carbamoyltransferase  67.44 
 
 		 305 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  56.9 
 
 		 302 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  54.67 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 		 301 aa  345  8e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 301 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 		 301 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0230  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 302 aa  344  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000828379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 		 302 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 301 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0204  ornithine carbamoyltransferase  54.7 
 
 		 301 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 301 aa  342  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 301 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0229  ornithine carbamoyltransferase  54.87 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 313 aa  325  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  45.22 
 
 		 313 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  43.63 
 
 		 313 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.04 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  43.05 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  42.39 
 
 		 316 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  41.83 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  42.07 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  41.37 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  42.19 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  41.88 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  41.88 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  41.64 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  41.5 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  41.5 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  42.57 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  41.53 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  40.86 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  42.33 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  43.09 
 
 		 317 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  41.78 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  40.85 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  43.58 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  44.67 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  43.33 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  41.14 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  43.24 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  43.24 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  42.02 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 		 307 aa  235  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  41.39 
 
 		 312 aa  235  9e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  40.98 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  42.16 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  40.59 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  41.39 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  40.47 
 
 		 309 aa  231  9e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  38.74 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  40.75 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  40.91 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  40 
 
 		 301 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  42.42 
 
 		 338 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  40.79 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  40.66 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  43.43 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  38.61 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  40.79 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  40 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  42.09 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  40.07 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  39.14 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  40.13 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  38.69 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  39.34 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  39.73 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  41.69 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  39.41 
 
 		 334 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  39.48 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  39.13 
 
 		 323 aa  221  9e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  39.39 
 
 		 318 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  40.52 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  39.53 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  41.25 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  39.33 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  40.92 
 
 		 306 aa  219  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  38.44 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  39.81 
 
 		 335 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>