More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0421 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
312 aa  641    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0930  ornithine carbamoyltransferase  69.33 
 
 
317 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000010052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06660  ornithine carbamoyltransferase  64.13 
 
 
331 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  64.52 
 
 
332 aa  411  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0484  ornithine carbamoyltransferase  63.23 
 
 
313 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0349  ornithine carbamoyltransferase  61.89 
 
 
332 aa  408  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0068  ornithine carbamoyltransferase  62.08 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0473  ornithine carbamoyltransferase  61.16 
 
 
332 aa  401  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  62.58 
 
 
312 aa  402  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0342  ornithine carbamoyltransferase  61.47 
 
 
332 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0421  ornithine carbamoyltransferase  61.47 
 
 
332 aa  401  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0408  ornithine carbamoyltransferase  61.16 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.297743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4897  ornithine carbamoyltransferase  60.55 
 
 
332 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2165  ornithine carbamoyltransferase  59.51 
 
 
337 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0450  ornithine carbamoyltransferase  57.23 
 
 
334 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.601732  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2091  ornithine carbamoyltransferase  56.8 
 
 
334 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.63428  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03645  ornithine carbamoyltransferase  56.36 
 
 
334 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2658  ornithine carbamoyltransferase  57.19 
 
 
336 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2714  ornithine carbamoyltransferase  57.19 
 
 
336 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  58.06 
 
 
313 aa  378  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002420  ornithine carbamoyltransferase  56.06 
 
 
334 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4748  ornithine carbamoyltransferase  55.72 
 
 
334 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4811  ornithine carbamoyltransferase  55.72 
 
 
334 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.278589  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4847  ornithine carbamoyltransferase  55.72 
 
 
334 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0520  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 
334 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4867  ornithine carbamoyltransferase  55.72 
 
 
334 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0162  ornithine carbamoyltransferase  56.36 
 
 
331 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0158  ornithine carbamoyltransferase  56.19 
 
 
331 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2708  ornithine carbamoyltransferase  55.66 
 
 
338 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 
313 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2249  ornithine carbamoyltransferase  54.57 
 
 
335 aa  363  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0929  ornithine carbamoyltransferase  55.96 
 
 
338 aa  360  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142101  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0860  ornithine carbamoyltransferase  53.99 
 
 
333 aa  360  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4817  ornithine carbamoyltransferase subunit I  55.52 
 
 
334 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4724  ornithine carbamoyltransferase subunit I  55.52 
 
 
334 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4853  ornithine carbamoyltransferase subunit I  55.52 
 
 
334 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4754  ornithine carbamoyltransferase subunit I  55.52 
 
 
334 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4872  ornithine carbamoyltransferase subunit I  55.52 
 
 
334 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0459  ornithine carbamoyltransferase subunit F  53.96 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0130179 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0425  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 
335 aa  356  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0090  ornithine carbamoyltransferase, catabolic  54.24 
 
 
331 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3732  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.66 
 
 
338 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0374  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.19 
 
 
335 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0554  ornithine carbamoyltransferase  53.66 
 
 
339 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.270537  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3332  ornithine carbamoyltransferase  53.61 
 
 
334 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1252  ornithine carbamoyltransferase  55.15 
 
 
333 aa  353  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4825  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.99 
 
 
337 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0425  ornithine carbamoyltransferase subunit I  52.89 
 
 
335 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1227  ornithine carbamoyltransferase  55.15 
 
 
333 aa  353  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.149639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4734  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.68 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488433  normal  0.892607 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.37 
 
 
334 aa  352  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2351  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
333 aa  352  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04120  ornithine carbamoyltransferase 1  53.37 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04084  hypothetical protein  53.37 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4510  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.37 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0746684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3758  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.37 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5775  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.37 
 
 
334 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2425  ornithine carbamoyltransferase  53.01 
 
 
334 aa  350  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2321  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 
354 aa  349  3e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1992  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 
334 aa  349  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4647  ornithine carbamoyltransferase  53.03 
 
 
333 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1876  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 
332 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4829  ornithine carbamoyltransferase subunit I  52.76 
 
 
334 aa  348  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3566  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.21 
 
 
339 aa  348  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4042  ornithine carbamoyltransferase subunit I  53.07 
 
 
335 aa  348  8e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4387  ornithine carbamoyltransferase  51.81 
 
 
336 aa  348  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5576  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 
332 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3549  ornithine carbamoyltransferase subunit I  52.76 
 
 
335 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3684  ornithine carbamoyltransferase subunit I  52.76 
 
 
335 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1457  ornithine carbamoyltransferase  51.07 
 
 
338 aa  347  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1000  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 
336 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2126  ornithine carbamoyltransferase  54.24 
 
 
332 aa  346  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1037  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 
336 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1908  ornithine carbamoyltransferase  55.97 
 
 
331 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000351047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0999  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 
336 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4224  ornithine carbamoyltransferase  51.2 
 
 
336 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0872  ornithine carbamoyltransferase  55.35 
 
 
327 aa  344  1e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00322562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2240  ornithine carbamoyltransferase  52.42 
 
 
333 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0433  ornithine carbamoyltransferase  52.73 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.776106  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6442  ornithine carbamoyltransferase  51.2 
 
 
336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.316397  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5912  ornithine carbamoyltransferase  50.3 
 
 
336 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2685  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
336 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.841413  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68340  ornithine carbamoyltransferase  50.3 
 
 
336 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.170592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2799  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1107  ornithine carbamoyltransferase  50.3 
 
 
336 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7762  normal  0.256568 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0182  ornithine carbamoyltransferase  52.6 
 
 
330 aa  334  9e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0747  ornithine carbamoyltransferase  50.61 
 
 
333 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0828856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4538  ornithine carbamoyltransferase  51.2 
 
 
336 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0837196  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5203  ornithine carbamoyltransferase  51.06 
 
 
334 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0245  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
336 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380448  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1146  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
336 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0914  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
336 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1986  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
336 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.370878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1586  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
336 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2127  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
336 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1967  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
336 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2385  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
336 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0499309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2176  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1976  ornithine carbamoyltransferase  50.91 
 
 
332 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1390  ornithine carbamoyltransferase  50.91 
 
 
334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00030197  normal  0.635885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>