More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0397 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0397  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
304 aa  625  1e-178  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0463662 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
309 aa  329  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  53.9 
 
 
305 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
301 aa  316  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
316 aa  315  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
320 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
306 aa  312  5.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 
316 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 
308 aa  311  9e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
312 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
312 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
302 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  46 
 
 
309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
316 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
316 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
316 aa  308  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 
303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
317 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
312 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
303 aa  305  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
298 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
316 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 
303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 
302 aa  302  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
304 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 
300 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
304 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
321 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  50.51 
 
 
302 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 
303 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
304 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
305 aa  298  7e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
308 aa  298  9e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
309 aa  296  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
303 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 
305 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 
308 aa  295  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  44.7 
 
 
304 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
301 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
312 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
314 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
312 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 
312 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
313 aa  291  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 
303 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
303 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
303 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
308 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  44.85 
 
 
305 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
328 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
310 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 
303 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
316 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
317 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  44.63 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  48.54 
 
 
312 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  44.82 
 
 
306 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
303 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
308 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 
323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  43.52 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  44 
 
 
310 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  46.78 
 
 
313 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
323 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
309 aa  280  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
306 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
305 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 
316 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
313 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
308 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  44.05 
 
 
313 aa  279  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  44.67 
 
 
302 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  45 
 
 
308 aa  279  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
307 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
329 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>