More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2132 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2132  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 371 aa  734    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  57.58 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1631  rod shape-determining protein RodA  63.04 
 
 		 322 aa  358  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  44.39 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  48.12 
 
 		 382 aa  291  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  48.48 
 
 		 385 aa  291  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  44.57 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  43.64 
 
 		 372 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  44.74 
 
 		 368 aa  278  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  43.68 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  43.68 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  43.68 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  43.39 
 
 		 368 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  43.18 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  43.18 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  46.55 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  43.82 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  44.28 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  43.21 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  43.21 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  43.06 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  46.29 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  43.82 
 
 		 368 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  44.07 
 
 		 373 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  42.48 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  43.34 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  43.49 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  43.66 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  46.28 
 
 		 371 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  44.06 
 
 		 364 aa  256  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 380 aa  255  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  44.06 
 
 		 403 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  41.43 
 
 		 374 aa  255  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  46.33 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  39.77 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1604  rod shape-determining protein RodA  44.63 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  41.78 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  40.87 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  42.6 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  41.64 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  41.99 
 
 		 382 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  41.39 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  40.92 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  42.3 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  41.39 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  41.99 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  41.39 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  43.06 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  43.64 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  41.4 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  40.29 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  41.84 
 
 		 372 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  44.38 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  42.15 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  41.4 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  40.22 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  42.69 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  41.06 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  40.92 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  40.5 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  44.34 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  41.08 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  39.58 
 
 		 382 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  39.27 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  43.35 
 
 		 390 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  43.35 
 
 		 390 aa  235  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  41.3 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  42.27 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  39.55 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  39.29 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  40.62 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  45.42 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1742  rod shape-determining protein RodA  40.78 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  41.4 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2025  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0161321  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  42.3 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  41.34 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  42.81 
 
 		 384 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  38.81 
 
 		 353 aa  232  9e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  40.97 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  39.57 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  43.37 
 
 		 366 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  41.27 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  45.76 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  41.79 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  43.3 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  40.59 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  38.24 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  39.66 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  39.66 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  39.66 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  46.47 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  41.88 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>