137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0489 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0489  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  51.47 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  45.59 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  41.43 
 
 		 856 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2202  response regulator receiver domain-containing protein  27.91 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.58 
 
 		 252 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1254  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 472 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.388952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  30.48 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  34.17 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  35.42 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.51 
 
 		 459 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 550 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0187  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  34.57 
 
 		 265 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 452 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0144454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1417  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 408 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 		 384 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0848  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.71 
 
 		 437 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0592297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1153  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.91 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  35.21 
 
 		 232 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1414  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  32.38 
 
 		 234 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  32.38 
 
 		 234 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  32.38 
 
 		 234 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 856 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.38 
 
 		 234 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5338  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.03 
 
 		 462 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  41.43 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  33.8 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  43.66 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3981  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4138  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.794435  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  32.93 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 261 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0741  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.63 
 
 		 216 aa  42.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.85 
 
 		 470 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3158  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  42.35 
 
 		 231 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  33.8 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 811 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1736  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.88 
 
 		 465 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2863  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.274162  normal  0.59867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  39.71 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 448 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  41.43 
 
 		 842 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2756  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1803  two component transcriptional regulator  39.71 
 
 		 232 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782093  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2893  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.88 
 
 		 460 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  0.0587462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 238 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 452 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2623  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 456 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1898  two component transcriptional regulator  32.86 
 
 		 245 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458999  normal  0.479409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 565 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2431  two component transcriptional regulator  36.76 
 
 		 225 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5762  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120401  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  35.21 
 
 		 232 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3098  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.85 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1091  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 460 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2943  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.723084  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 965 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 232 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 225 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  41.79 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 544 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15001  response regulator  32.47 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.608527  normal  0.0430708 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  30.48 
 
 		 234 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.68 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.68 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.68 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.68 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.68 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.49 
 
 		 456 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  39.68 
 
 		 241 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.1 
 
 		 458 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.162426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3052  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.83 
 
 		 541 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 410 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>