More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1751 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
228 aa  437  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.54 
 
 
228 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316693  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11220  short-chain alcohol dehydrogenase  65.49 
 
 
228 aa  288  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.266926  normal  0.0891771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.02 
 
 
226 aa  275  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.43 
 
 
228 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0331408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.77 
 
 
233 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.378892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.09 
 
 
244 aa  255  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
242 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
249 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
251 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
259 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
251 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1014  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
251 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
251 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1390  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
251 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
251 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
251 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3043  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
251 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1794  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
238 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.012898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3172  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.19 
 
 
251 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4388  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520799  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
271 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4881  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
271 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169206  normal  0.0484523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.03 
 
 
241 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.17 
 
 
236 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0734  putative short chain dehydrogenase  36 
 
 
242 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.491859  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
231 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
231 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
260 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32420  predicted protein  29.91 
 
 
333 aa  95.1  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.303596  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
245 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5189  gluconate 5-dehydrogenase (5-keto-D-gluconate 5- reductase)  37.69 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1309  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.61 
 
 
236 aa  92  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.16 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4200  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.91 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
264 aa  90.1  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
281 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.534322  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.746696  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.772329 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04541  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  31.14 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0716484  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  30.97 
 
 
239 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.09 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.63 
 
 
230 aa  89  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
236 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.433499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
258 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
233 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.83 
 
 
258 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
230 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.21224  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
291 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8710  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  34.2 
 
 
258 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.09 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.89 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.04 
 
 
249 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.12 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1855  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.555083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
233 aa  87  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
256 aa  87  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
268 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
246 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.29 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
248 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.85 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4528  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.38 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>