More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1482 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  72.29 
 
 		 464 aa  715    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  80.09 
 
 		 463 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  72.54 
 
 		 450 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  100 
 
 		 463 aa  969    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  54.42 
 
 		 487 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  55.21 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  53.98 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  53.98 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  54.2 
 
 		 452 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  54.2 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  54.65 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  53.98 
 
 		 487 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  55.58 
 
 		 426 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  54.85 
 
 		 452 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  53.96 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  55.82 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  52.48 
 
 		 457 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  54.61 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  51.1 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  52.64 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  49.67 
 
 		 455 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  52.64 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  52.64 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  48.46 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  48.24 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  47.01 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  47.65 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  46.48 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  47.36 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  45.25 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  46.28 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  44.3 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  47.22 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.46 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  28.98 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1024  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27 
 
 		 434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1791  aminotransferase class-III  27.1 
 
 		 466 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0602561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.33 
 
 		 456 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.85 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.17 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.79 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.06 
 
 		 432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.05 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3859  aminotransferase class-III  26 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.28 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.87 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.06 
 
 		 430 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.16 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.16 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.87 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.54 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.96 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.16 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.36 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.91 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  25.99 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.49 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.52 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.47 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.52 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.85 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.6 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  26.8 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.12 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  26.32 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.77 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.38 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  26.58 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2572  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.46 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.46 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.64 
 
 		 430 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.35 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0261  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.99 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.76 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.35 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.71 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.68 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  25.57 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.43 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.76 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.21 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.32 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.49 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.42 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.06 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.49 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0898  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.15 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2502  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.99 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  26.85 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.86 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.85 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.22 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.82 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.82 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.22 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0982  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.7 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.272083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.82 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.22 
 
 		 430 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.33 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.11 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>