More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1119 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  100 
 
 
447 aa  904    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  55.2 
 
 
452 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  54.73 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  54.73 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  54.97 
 
 
487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  55.2 
 
 
499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  54.73 
 
 
487 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  55.42 
 
 
426 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  56.32 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  55.17 
 
 
455 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  55.4 
 
 
452 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  55.63 
 
 
452 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  55.17 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  53.86 
 
 
457 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  53.41 
 
 
457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  55.42 
 
 
557 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  51.59 
 
 
457 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  50.45 
 
 
462 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  54.48 
 
 
460 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  50 
 
 
464 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  54.84 
 
 
454 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  49.77 
 
 
450 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  47.78 
 
 
463 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  54.48 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  54.48 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  49.08 
 
 
457 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  46 
 
 
463 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  47.11 
 
 
453 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  46.59 
 
 
461 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  46.44 
 
 
459 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  45.95 
 
 
462 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  42.73 
 
 
450 aa  322  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  41.63 
 
 
451 aa  296  6e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.57 
 
 
457 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.91 
 
 
438 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33 
 
 
430 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3859  aminotransferase class-III  29.78 
 
 
449 aa  169  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.59 
 
 
434 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.22 
 
 
426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.92 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.22 
 
 
432 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
428 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
429 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.25 
 
 
427 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.6 
 
 
426 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.09 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.42 
 
 
428 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.99 
 
 
429 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.99 
 
 
429 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.86 
 
 
456 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.99 
 
 
429 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.99 
 
 
429 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.99 
 
 
429 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.71 
 
 
429 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.85 
 
 
433 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.71 
 
 
429 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.17 
 
 
434 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.4 
 
 
430 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31 
 
 
433 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.56 
 
 
451 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.25 
 
 
428 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.23 
 
 
417 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.03 
 
 
430 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1373  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.78 
 
 
427 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3303  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.28 
 
 
430 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2901  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.28 
 
 
430 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0920757  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.14 
 
 
418 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0847  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.23 
 
 
428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00900779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.07 
 
 
425 aa  156  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1968  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.15 
 
 
431 aa  156  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6505  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.05 
 
 
429 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.25 
 
 
437 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.77 
 
 
427 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  32.47 
 
 
473 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.48 
 
 
425 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.75 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.64 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.41 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1791  aminotransferase class-III  30.14 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0602561  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.75 
 
 
428 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1109  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.87 
 
 
430 aa  154  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.77 
 
 
427 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.76 
 
 
431 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.57 
 
 
428 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.46 
 
 
427 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.5 
 
 
427 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.94 
 
 
427 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4475  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.6 
 
 
428 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.68 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.64 
 
 
427 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.23 
 
 
429 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3357  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.55 
 
 
442 aa  153  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249572  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.22 
 
 
432 aa  153  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.85 
 
 
427 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0940  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.41 
 
 
424 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.995073  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11660  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.64 
 
 
429 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.545154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.14 
 
 
424 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.52 
 
 
428 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>