More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0216 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
417 aa  854    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  62.74 
 
 
418 aa  568  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1717  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.15 
 
 
441 aa  437  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.54 
 
 
430 aa  432  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.22 
 
 
432 aa  421  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.71 
 
 
429 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.1 
 
 
427 aa  412  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.14 
 
 
427 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.43 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2254  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.24 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100829  normal  0.0981223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.43 
 
 
427 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.52 
 
 
424 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0114  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.76 
 
 
424 aa  393  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1900  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.8 
 
 
424 aa  390  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0921837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0525  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.22 
 
 
412 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0303204  normal  0.794843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.52 
 
 
431 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.38 
 
 
422 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1726  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.95 
 
 
420 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.72 
 
 
451 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1235  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.38 
 
 
413 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0633265  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.72 
 
 
432 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  44.63 
 
 
430 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.09 
 
 
626 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.05 
 
 
432 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.03 
 
 
422 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.39 
 
 
432 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  47.48 
 
 
437 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.81 
 
 
430 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.75 
 
 
432 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.15 
 
 
428 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.13 
 
 
431 aa  378  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.21 
 
 
430 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.21 
 
 
433 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.97 
 
 
432 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.8 
 
 
422 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0982  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.41 
 
 
415 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.272083  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.28 
 
 
428 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0490  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.32 
 
 
424 aa  376  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.86 
 
 
426 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.86 
 
 
426 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.15 
 
 
426 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.1 
 
 
426 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.39 
 
 
426 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.39 
 
 
426 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.39 
 
 
426 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.91 
 
 
427 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.79 
 
 
433 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.68 
 
 
433 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.15 
 
 
426 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.63 
 
 
426 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.68 
 
 
433 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.15 
 
 
426 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.39 
 
 
426 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0113  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.48 
 
 
435 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.79 
 
 
427 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4475  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.61 
 
 
428 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.02 
 
 
434 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.92 
 
 
426 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.39 
 
 
426 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.39 
 
 
426 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.32 
 
 
433 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.39 
 
 
426 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2085  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.48 
 
 
435 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.5 
 
 
432 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.39 
 
 
426 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  45.39 
 
 
426 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.5 
 
 
426 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.39 
 
 
428 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.21 
 
 
428 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.41 
 
 
426 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.94 
 
 
428 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.1 
 
 
426 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.39 
 
 
428 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.26 
 
 
438 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.5 
 
 
430 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.8 
 
 
430 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.15 
 
 
426 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.69 
 
 
432 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.31 
 
 
432 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11660  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  46.87 
 
 
429 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.545154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.02 
 
 
428 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.35 
 
 
427 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.78 
 
 
413 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.6 
 
 
428 aa  365  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.15 
 
 
426 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  45.63 
 
 
429 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  43.8 
 
 
429 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.02 
 
 
428 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.69 
 
 
426 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.29 
 
 
428 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.15 
 
 
429 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.38 
 
 
429 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.95 
 
 
427 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12310  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.22 
 
 
428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0595101  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.26 
 
 
434 aa  362  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.08 
 
 
427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.13 
 
 
429 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3303  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.02 
 
 
430 aa  362  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.44 
 
 
426 aa  361  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.38 
 
 
428 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>