More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3356 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  80.8 
 
 
427 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  79.76 
 
 
428 aa  708    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.28 
 
 
427 aa  700    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
427 aa  875    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  78.92 
 
 
427 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.05 
 
 
427 aa  702    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  75.88 
 
 
428 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.47 
 
 
427 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64 
 
 
432 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.53 
 
 
445 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.53 
 
 
431 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  58.45 
 
 
430 aa  548  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0202  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.99 
 
 
431 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.518998  normal  0.0385329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.03 
 
 
428 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2800  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.14 
 
 
431 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.279066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.12 
 
 
427 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.41 
 
 
429 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  62.14 
 
 
432 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.33 
 
 
626 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1258  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  63.1 
 
 
430 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.535186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.8 
 
 
427 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.61 
 
 
430 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
428 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.81 
 
 
431 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.18 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  61.88 
 
 
425 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.47 
 
 
428 aa  535  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.18 
 
 
426 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.18 
 
 
426 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2038  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.28 
 
 
431 aa  536  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251047  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.18 
 
 
426 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.15 
 
 
431 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.543166  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2572  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.59 
 
 
431 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  58.69 
 
 
433 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1968  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
431 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  60.14 
 
 
437 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.05 
 
 
426 aa  531  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.57 
 
 
432 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.47 
 
 
426 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.94 
 
 
426 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.29 
 
 
430 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2394  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.72 
 
 
431 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.81 
 
 
430 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.76 
 
 
427 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.57 
 
 
432 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  60.71 
 
 
426 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  58.08 
 
 
432 aa  528  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.29 
 
 
430 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.75 
 
 
432 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.62 
 
 
433 aa  529  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.81 
 
 
430 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.53 
 
 
430 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.53 
 
 
430 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.47 
 
 
426 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.53 
 
 
430 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.05 
 
 
430 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.53 
 
 
427 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
426 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.81 
 
 
430 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.24 
 
 
429 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.76 
 
 
427 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.98 
 
 
433 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.05 
 
 
426 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.53 
 
 
426 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.28 
 
 
426 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.28 
 
 
437 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.19 
 
 
431 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.24 
 
 
426 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.34 
 
 
431 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.21 
 
 
432 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.28 
 
 
426 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.15 
 
 
428 aa  524  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60 
 
 
427 aa  528  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.98 
 
 
433 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.53 
 
 
427 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.35 
 
 
429 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59.53 
 
 
427 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60 
 
 
429 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.78 
 
 
428 aa  523  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.53 
 
 
427 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.29 
 
 
427 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0645  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.69 
 
 
453 aa  523  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.29 
 
 
426 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  58.55 
 
 
432 aa  521  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.08 
 
 
441 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59.76 
 
 
426 aa  522  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.76 
 
 
426 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59.57 
 
 
426 aa  518  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.21 
 
 
432 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.06 
 
 
427 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.1 
 
 
438 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>