More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0982 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0982  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
415 aa  840    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.272083  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1235  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  73.37 
 
 
413 aa  623  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0633265  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1726  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.6 
 
 
420 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2560  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.23 
 
 
417 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0525  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.99 
 
 
412 aa  567  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0303204  normal  0.794843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.35 
 
 
424 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.01 
 
 
429 aa  472  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.78 
 
 
422 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.32 
 
 
626 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.93 
 
 
451 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.93 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.99 
 
 
427 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.23 
 
 
427 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.69 
 
 
428 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.62 
 
 
427 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.92 
 
 
432 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.08 
 
 
427 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.99 
 
 
427 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.98 
 
 
428 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.45 
 
 
427 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.12 
 
 
430 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.97 
 
 
430 aa  394  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1258  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  50.24 
 
 
430 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.535186  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  50.85 
 
 
437 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.25 
 
 
430 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.12 
 
 
430 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.45 
 
 
427 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.72 
 
 
427 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0645  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50 
 
 
453 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50.84 
 
 
431 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.773793  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.15 
 
 
429 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.43 
 
 
429 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.75 
 
 
427 aa  385  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.21 
 
 
428 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.38 
 
 
418 aa  380  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50 
 
 
433 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.15 
 
 
441 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  45.06 
 
 
430 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  50 
 
 
433 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.45 
 
 
425 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.99 
 
 
426 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.41 
 
 
417 aa  376  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  49.4 
 
 
427 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.54 
 
 
432 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.32 
 
 
428 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4475  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  50 
 
 
428 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0936  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.24 
 
 
430 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.579841  normal  0.783597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.82 
 
 
432 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.68 
 
 
428 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.45 
 
 
426 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.89 
 
 
429 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  49.39 
 
 
432 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3003  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  49.16 
 
 
422 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.32 
 
 
426 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.68 
 
 
426 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.69 
 
 
430 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.03 
 
 
437 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0711  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.83 
 
 
423 aa  373  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.71 
 
 
430 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.76 
 
 
432 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.6 
 
 
444 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2530  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.93 
 
 
427 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00381454  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.52 
 
 
432 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.52 
 
 
426 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.12 
 
 
427 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.48 
 
 
433 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.6 
 
 
444 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.6 
 
 
433 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.37 
 
 
432 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  49.04 
 
 
439 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.54 
 
 
430 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.52 
 
 
432 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.05 
 
 
434 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47 
 
 
428 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.52 
 
 
428 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1717  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.4 
 
 
441 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  49.16 
 
 
432 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.94 
 
 
427 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.2 
 
 
427 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.02 
 
 
431 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.3 
 
 
427 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.57 
 
 
425 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.2 
 
 
431 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.12 
 
 
432 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1373  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.15 
 
 
427 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.5 
 
 
445 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.97 
 
 
426 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.09 
 
 
435 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.28 
 
 
426 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1024  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  43.1 
 
 
434 aa  364  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.76 
 
 
426 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.8 
 
 
426 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.28 
 
 
426 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.28 
 
 
426 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.28 
 
 
426 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.28 
 
 
426 aa  363  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  46.28 
 
 
426 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.32 
 
 
432 aa  363  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.28 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.82 
 
 
427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>