More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3953 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  100 
 
 
455 aa  912    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  55.78 
 
 
450 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  55.96 
 
 
464 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  57.55 
 
 
487 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  57.55 
 
 
452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  57.55 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  53.94 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  57.08 
 
 
426 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  57.08 
 
 
452 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  57.08 
 
 
452 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  57.08 
 
 
487 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  56.06 
 
 
452 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  56.38 
 
 
452 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  56.61 
 
 
452 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  53.32 
 
 
457 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  55.84 
 
 
452 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  49.67 
 
 
463 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  56.37 
 
 
557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  53.46 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  53.23 
 
 
457 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  54.97 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  53 
 
 
457 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  55.61 
 
 
454 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  50.8 
 
 
462 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  54.69 
 
 
460 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  54.92 
 
 
460 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  54.92 
 
 
460 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  51.29 
 
 
459 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  49.41 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  49.45 
 
 
461 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  50.12 
 
 
462 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  46.96 
 
 
451 aa  360  2e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  46.96 
 
 
450 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  34.17 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.87 
 
 
457 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.8 
 
 
432 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.59 
 
 
430 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.56 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.73 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.6 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.6 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.99 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0093  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.22 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.42 
 
 
438 aa  173  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.51 
 
 
430 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.01 
 
 
429 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.51 
 
 
430 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5930  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.15 
 
 
431 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.16 
 
 
430 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.91 
 
 
456 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.9 
 
 
431 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.8 
 
 
429 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.66 
 
 
438 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.25 
 
 
430 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.26 
 
 
427 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0940  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.48 
 
 
424 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.995073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.67 
 
 
431 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.95 
 
 
429 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0869  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.23 
 
 
424 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.79 
 
 
429 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.5 
 
 
425 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00716441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.08 
 
 
435 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.29 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1002  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.97 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.05195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.91 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.16 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3859  aminotransferase class-III  28.54 
 
 
449 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11660  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.22 
 
 
429 aa  163  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.545154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.06 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.04 
 
 
432 aa  162  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.4 
 
 
430 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1791  aminotransferase class-III  27.89 
 
 
466 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0602561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2017  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.36 
 
 
423 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0031552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.65 
 
 
428 aa  160  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3902  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.59 
 
 
427 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.36 
 
 
452 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  26.74 
 
 
430 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.04 
 
 
427 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.15 
 
 
430 aa  160  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.27 
 
 
418 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.34 
 
 
427 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.91 
 
 
427 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.44 
 
 
422 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.99 
 
 
426 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1034  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.18 
 
 
444 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.54 
 
 
427 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.1 
 
 
413 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.08 
 
 
433 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0797  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.05 
 
 
429 aa  157  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.71 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.68 
 
 
457 aa  156  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2502  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.27 
 
 
425 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0847  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.62 
 
 
428 aa  156  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00900779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3086  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.69 
 
 
436 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.156585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>