More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0060 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  85.68 
 
 
426 aa  754    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  84.29 
 
 
452 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  84.73 
 
 
452 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  100 
 
 
452 aa  924    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  84.29 
 
 
452 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  76.87 
 
 
454 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  85.04 
 
 
557 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  92.46 
 
 
452 aa  834    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  85.08 
 
 
499 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  93.14 
 
 
452 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  84.86 
 
 
487 aa  768    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  93.58 
 
 
452 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  84.63 
 
 
487 aa  767    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  66.82 
 
 
460 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  66.89 
 
 
460 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  66.89 
 
 
460 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  61.36 
 
 
450 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  58.7 
 
 
462 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  60 
 
 
463 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  60.91 
 
 
464 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  54.65 
 
 
463 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  55.56 
 
 
457 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  56.06 
 
 
455 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  53.86 
 
 
453 aa  474  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  54.85 
 
 
459 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  55.53 
 
 
462 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  52.89 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  52.67 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  54.05 
 
 
461 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  53.74 
 
 
457 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  57.25 
 
 
447 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  53.88 
 
 
450 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  48.6 
 
 
451 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  35.37 
 
 
473 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.62 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.85 
 
 
456 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.91 
 
 
430 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.56 
 
 
429 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.56 
 
 
428 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.56 
 
 
429 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.56 
 
 
429 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.67 
 
 
438 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1791  aminotransferase class-III  29.93 
 
 
466 aa  171  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0602561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.31 
 
 
429 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.31 
 
 
429 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.31 
 
 
429 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.31 
 
 
429 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.31 
 
 
429 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.31 
 
 
429 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.51 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.33 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.85 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.54 
 
 
429 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.65 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.33 
 
 
430 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.52 
 
 
437 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0093  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.34 
 
 
433 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.97 
 
 
434 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.31 
 
 
427 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.15 
 
 
432 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3859  aminotransferase class-III  27.25 
 
 
449 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0898  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.98 
 
 
437 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.89 
 
 
430 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.92 
 
 
438 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.73 
 
 
427 aa  156  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.6 
 
 
426 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.49 
 
 
430 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.42 
 
 
432 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.49 
 
 
430 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.79 
 
 
430 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3086  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.93 
 
 
436 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.82 
 
 
429 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.18 
 
 
428 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.18 
 
 
428 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  28.82 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5127  aminotransferase class-III  34.16 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.53 
 
 
431 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.09 
 
 
626 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.24 
 
 
434 aa  153  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2109  aminotransferase class-III  34.91 
 
 
468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.336776  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.8 
 
 
432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.24 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.06 
 
 
427 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.34 
 
 
429 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.8 
 
 
427 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1133  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.08 
 
 
442 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0808727  normal  0.150983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.15 
 
 
431 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.77 
 
 
432 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.25 
 
 
427 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3024  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.44 
 
 
437 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.42 
 
 
437 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1201  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.65 
 
 
426 aa  149  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1369  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.03 
 
 
436 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.59 
 
 
439 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.38 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1608  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.25 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.23 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0261  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.71 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.98 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0829  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.24 
 
 
432 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.993042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>