More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2747 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  100 
 
 
452 aa  926    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.74 
 
 
433 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.67 
 
 
433 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.18 
 
 
428 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.67 
 
 
433 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  58.29 
 
 
432 aa  508  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.74 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.78 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.02 
 
 
432 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  58.12 
 
 
437 aa  505  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.31 
 
 
432 aa  505  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.29 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.37 
 
 
432 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0645  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.91 
 
 
453 aa  501  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.63 
 
 
431 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.6 
 
 
433 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.43 
 
 
430 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.42 
 
 
426 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59.05 
 
 
426 aa  498  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
426 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  57.42 
 
 
426 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.75 
 
 
430 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.97 
 
 
433 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.18 
 
 
426 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.42 
 
 
434 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.18 
 
 
426 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.42 
 
 
426 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.42 
 
 
426 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
426 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.18 
 
 
426 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  58 
 
 
431 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.94 
 
 
426 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.29 
 
 
426 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0202  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.45 
 
 
431 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.518998  normal  0.0385329 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.94 
 
 
426 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.94 
 
 
426 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56 
 
 
426 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.7 
 
 
426 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.98 
 
 
432 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.47 
 
 
427 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.69 
 
 
428 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  53.76 
 
 
430 aa  496  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.87 
 
 
426 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.35 
 
 
427 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.9 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.46 
 
 
426 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.12 
 
 
428 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.89 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.06 
 
 
428 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.89 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.43 
 
 
441 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.94 
 
 
451 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.46 
 
 
426 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.41 
 
 
428 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.13 
 
 
428 aa  488  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.98 
 
 
431 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.22 
 
 
426 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.74 
 
 
432 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.12 
 
 
430 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.23 
 
 
428 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.7 
 
 
426 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  54.52 
 
 
626 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.88 
 
 
427 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50966  predicted protein  54.48 
 
 
468 aa  487  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.1 
 
 
429 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.53 
 
 
427 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.4 
 
 
431 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
426 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.83 
 
 
427 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
426 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
430 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.16 
 
 
432 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.18 
 
 
428 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
430 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
430 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.46 
 
 
444 aa  484  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
430 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.5 
 
 
429 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.93 
 
 
428 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
429 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.46 
 
 
444 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.5 
 
 
430 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.61 
 
 
426 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.64 
 
 
426 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.16 
 
 
445 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.29 
 
 
427 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  55.12 
 
 
430 aa  481  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.5 
 
 
430 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.5 
 
 
430 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.14 
 
 
430 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.82 
 
 
431 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.543166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.53 
 
 
432 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2800  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.98 
 
 
431 aa  481  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.279066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.82 
 
 
427 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.63 
 
 
429 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.74 
 
 
413 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1968  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.03 
 
 
431 aa  480  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.74 
 
 
438 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.92 
 
 
427 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.67 
 
 
428 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>