More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50966 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.77 
 
 
432 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50966  predicted protein  100 
 
 
468 aa  957    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.47 
 
 
433 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.47 
 
 
433 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  68.91 
 
 
432 aa  624  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  68.84 
 
 
433 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  68.68 
 
 
432 aa  623  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.05 
 
 
433 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.57 
 
 
428 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0645  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.84 
 
 
453 aa  614  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.67 
 
 
433 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.82 
 
 
432 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.59 
 
 
432 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.61 
 
 
428 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.98 
 
 
428 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.2 
 
 
433 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.66 
 
 
434 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.98 
 
 
432 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28523  predicted protein  63.71 
 
 
469 aa  590  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67 
 
 
413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  55.9 
 
 
430 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.1 
 
 
427 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.63 
 
 
434 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.48 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.73 
 
 
427 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
432 aa  504  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.81 
 
 
432 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.28 
 
 
430 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.79 
 
 
427 aa  498  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.59 
 
 
429 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.37 
 
 
427 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  56.44 
 
 
437 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.19 
 
 
428 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.59 
 
 
429 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.35 
 
 
428 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.59 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.12 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.35 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.26 
 
 
430 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.35 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.35 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.06 
 
 
428 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.12 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  55.53 
 
 
432 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.35 
 
 
429 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.7 
 
 
432 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.16 
 
 
428 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2038  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.79 
 
 
431 aa  491  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251047  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  54.93 
 
 
626 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0202  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.97 
 
 
431 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.518998  normal  0.0385329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.06 
 
 
429 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.69 
 
 
428 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.98 
 
 
428 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.88 
 
 
430 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.88 
 
 
430 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.93 
 
 
428 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56 
 
 
428 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.6 
 
 
429 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.95 
 
 
438 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.12 
 
 
430 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56 
 
 
428 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.82 
 
 
428 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  54.48 
 
 
452 aa  487  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  54.59 
 
 
426 aa  482  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.12 
 
 
430 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.65 
 
 
430 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.25 
 
 
431 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2394  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.49 
 
 
431 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.99 
 
 
427 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.41 
 
 
427 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.29 
 
 
426 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2800  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.73 
 
 
431 aa  478  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.279066  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.99 
 
 
433 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  55.06 
 
 
451 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.11 
 
 
431 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.543166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.99 
 
 
426 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  53.99 
 
 
426 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.46 
 
 
427 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.65 
 
 
430 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.01 
 
 
427 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
426 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
426 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.01 
 
 
441 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  53.41 
 
 
427 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.99 
 
 
426 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.99 
 
 
426 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
426 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.01 
 
 
427 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.65 
 
 
430 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.41 
 
 
430 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.99 
 
 
426 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
426 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.99 
 
 
426 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
426 aa  477  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.88 
 
 
427 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.76 
 
 
426 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  53.99 
 
 
426 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.12 
 
 
426 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.65 
 
 
428 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54 
 
 
429 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>