More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3050 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  87.14 
 
 		 457 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  86.47 
 
 		 457 aa  800    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  100 
 
 		 457 aa  922    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  54.38 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  54.38 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  54.61 
 
 		 487 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  54.38 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  54.38 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  54.38 
 
 		 499 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  53 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  54.35 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  53.74 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  53.59 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  53.97 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  50.34 
 
 		 457 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  53.79 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  48.57 
 
 		 463 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  50.55 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  53.06 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  50.79 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  53.85 
 
 		 557 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  46.7 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  49.65 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  50.34 
 
 		 462 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  48.98 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  52.35 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  52.9 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  52.9 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  51.75 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  47.53 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  47.06 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  46.57 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  43.21 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.25 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  30.59 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.16 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0847  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.18 
 
 		 428 aa  172  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00900779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.34 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.54 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.12 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.51 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.06 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.78 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.52 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.94 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.07 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.61 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.9 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.79 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.44 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.09 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.51 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.43 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.06 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.81 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  27.42 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2625  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.35 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.54 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0185  aminotransferase class-III  31.5 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12310  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.96 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0595101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2040  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.8 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.108556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.03 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.3 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.11 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.08 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1717  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.67 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.64 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.87 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.58 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.17 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.84 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.13 
 
 		 430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11660  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.71 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.545154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.32 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.54 
 
 		 427 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1396  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.3 
 
 		 440 aa  153  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 428 aa  153  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  26.82 
 
 		 430 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.62 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.81 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.9 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0261  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.65 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.27 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.23 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1569  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.05 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.36 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.18 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.64 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>