More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  96.67 
 
 		 464 aa  894    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  78.4 
 
 		 463 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  100 
 
 		 450 aa  923    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  72.54 
 
 		 463 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  61.28 
 
 		 487 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  61.28 
 
 		 452 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  61.28 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  61.63 
 
 		 426 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  60.82 
 
 		 452 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  60.82 
 
 		 452 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  60.82 
 
 		 487 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  61.36 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  61.28 
 
 		 452 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  61.31 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  60.14 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  61.82 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  59.91 
 
 		 452 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  56.54 
 
 		 462 aa  504  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  55.78 
 
 		 455 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  57.79 
 
 		 460 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  54.65 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  57.79 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  57.79 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  52.37 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  52.14 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  53.05 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  51.02 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  50.68 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  50.56 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  52.02 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  52.71 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  49.54 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  49.65 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  33.04 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.35 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.23 
 
 		 456 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.75 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3859  aminotransferase class-III  28.86 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1791  aminotransferase class-III  30.56 
 
 		 466 aa  176  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0602561  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.53 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.61 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.05 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.22 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.31 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  29.69 
 
 		 452 aa  169  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.29 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.04 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.01 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.99 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.93 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.03 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.19 
 
 		 432 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.29 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.73 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.37 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.41 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.32 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.14 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.99 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.75 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.22 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.3 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.24 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.76 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0485  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.82 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.24 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.76 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.76 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.78 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.24 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.24 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1717  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.86 
 
 		 441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.31 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.24 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.95 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.14 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.14 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.14 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.41 
 
 		 432 aa  156  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.49 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2502  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.55 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.89 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.03 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.95 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.92 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.4 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.82 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.49 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.98 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.98 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.98 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.03 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.77 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.98 
 
 		 430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.03 
 
 		 430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.72 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.81 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.76 
 
 		 430 aa  152  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>