More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1272 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  100 
 
 		 426 aa  868    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  100 
 
 		 452 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  99.56 
 
 		 452 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  84.29 
 
 		 452 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  84.92 
 
 		 452 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  84.26 
 
 		 452 aa  755    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  92.68 
 
 		 557 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  100 
 
 		 452 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  79.38 
 
 		 454 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  99.34 
 
 		 487 aa  911    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  99.34 
 
 		 499 aa  911    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  83.81 
 
 		 452 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  99.78 
 
 		 487 aa  915    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  68.16 
 
 		 460 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  68.16 
 
 		 460 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  68.16 
 
 		 460 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  60.86 
 
 		 450 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  59.96 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  58.76 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  56.86 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  53.98 
 
 		 463 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  53.66 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  56.06 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  53.91 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  53.91 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  54.87 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  54.14 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  54.05 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  51.12 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  51.24 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  55.01 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  52.91 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  47.34 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  35.01 
 
 		 473 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.06 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.48 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3859  aminotransferase class-III  28.38 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.25 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1791  aminotransferase class-III  29.4 
 
 		 466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0602561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.81 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.87 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.36 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.63 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.63 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.63 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0898  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.82 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.44 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.33 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.21 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.16 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3086  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.05 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0940  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.92 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.995073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.63 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.07 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  29.39 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.47 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.47 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.66 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.51 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1201  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.64 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.91 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.1 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.51 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.07 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.51 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0869  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.92 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112445  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0847  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.18 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00900779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.26 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.26 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.26 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.26 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.26 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.62 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.26 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.27 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.35 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1002  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.76 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.05195  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.97 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346757  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.57 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.57 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.72 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1726  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.17 
 
 		 427 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.26 
 
 		 429 aa  146  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.22 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.48 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.35 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.24 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.35 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2109  aminotransferase class-III  35.47 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.336776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.82 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1109  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.75 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.57 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.1 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.1 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.98 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00650  Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.23 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.98 
 
 		 413 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.61 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.04 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>