More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0898 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3024  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  83.68 
 
 
437 aa  743    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1569  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  74.48 
 
 
438 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1369  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  81.15 
 
 
436 aa  703    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1133  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  82.79 
 
 
442 aa  728    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0808727  normal  0.150983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  78.35 
 
 
437 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  78.52 
 
 
436 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108936  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  80.93 
 
 
431 aa  702    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2904  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  86.11 
 
 
434 aa  754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0898  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
437 aa  880    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3357  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  79.58 
 
 
442 aa  708    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249572  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3581  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  85.88 
 
 
434 aa  752    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.5 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.27 
 
 
427 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2625  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64.34 
 
 
429 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0558  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.3 
 
 
433 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.655288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0610  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.79 
 
 
433 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.74 
 
 
430 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64.71 
 
 
426 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.04 
 
 
433 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2436  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.18 
 
 
427 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0831  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.94 
 
 
427 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.59 
 
 
425 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1543  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.39 
 
 
427 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4065  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.7 
 
 
427 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149414  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0482  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.46 
 
 
427 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0822  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.7 
 
 
427 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.46 
 
 
427 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3064  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.91 
 
 
427 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2601  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.91 
 
 
427 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2142  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.91 
 
 
427 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3099  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.91 
 
 
569 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0923  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  65.46 
 
 
427 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477129  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.91 
 
 
514 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0768  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.91 
 
 
502 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.67 
 
 
480 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.67 
 
 
425 aa  525  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0261  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.68 
 
 
433 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.51 
 
 
428 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.31 
 
 
428 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3683  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.72 
 
 
427 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.93 
 
 
434 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3902  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
427 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.64 
 
 
427 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.16 
 
 
438 aa  491  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.28 
 
 
426 aa  488  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
426 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
426 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  57.82 
 
 
426 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
426 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
426 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
426 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.87 
 
 
431 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
426 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.58 
 
 
426 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
426 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0827  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.53 
 
 
423 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.215136  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.58 
 
 
426 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.58 
 
 
426 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.58 
 
 
426 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.35 
 
 
426 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.58 
 
 
426 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.35 
 
 
426 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.08 
 
 
427 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.11 
 
 
426 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
441 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  54.98 
 
 
426 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.35 
 
 
426 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  54.98 
 
 
425 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.4 
 
 
426 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.64 
 
 
427 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3303  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.67 
 
 
430 aa  474  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.79 
 
 
428 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.55 
 
 
428 aa  475  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.16 
 
 
426 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.16 
 
 
426 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2901  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.67 
 
 
430 aa  474  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0920757  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.92 
 
 
426 aa  474  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.61 
 
 
428 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  53.88 
 
 
425 aa  475  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.35 
 
 
426 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.79 
 
 
429 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.16 
 
 
426 aa  471  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.03 
 
 
428 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.16 
 
 
429 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.32 
 
 
432 aa  473  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.12 
 
 
442 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000011434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.48 
 
 
426 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0113  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.56 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.63 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2085  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  52.56 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.69 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.56 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.74 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.98 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.21 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.98 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.21 
 
 
427 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.38 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.43 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  53.27 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>