More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0827 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0827  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
423 aa  870    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.215136  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  66.59 
 
 
426 aa  598  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.11 
 
 
428 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  64.68 
 
 
427 aa  588  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64.34 
 
 
426 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  64.99 
 
 
426 aa  578  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  64.93 
 
 
425 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  64.66 
 
 
426 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64.44 
 
 
432 aa  569  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.77 
 
 
427 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.8 
 
 
427 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.71 
 
 
428 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.18 
 
 
431 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.05 
 
 
427 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.58 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  62.09 
 
 
429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.47 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.25 
 
 
428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0600  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.01 
 
 
430 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
426 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.29 
 
 
426 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
426 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.58 
 
 
430 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
426 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.05 
 
 
426 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.53 
 
 
438 aa  555  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.05 
 
 
426 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.05 
 
 
427 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
426 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.58 
 
 
429 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  61.81 
 
 
426 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.29 
 
 
426 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
426 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
430 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
430 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.58 
 
 
430 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.34 
 
 
430 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.05 
 
 
426 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.34 
 
 
427 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.1 
 
 
430 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.34 
 
 
427 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.86 
 
 
427 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.05 
 
 
426 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.1 
 
 
430 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.05 
 
 
426 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.1 
 
 
430 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.1 
 
 
430 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
426 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.29 
 
 
427 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  61.58 
 
 
426 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.34 
 
 
427 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.81 
 
 
426 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.61 
 
 
431 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.14 
 
 
445 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.05 
 
 
429 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.01 
 
 
429 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.62 
 
 
427 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.34 
 
 
426 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.58 
 
 
426 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.82 
 
 
425 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.29 
 
 
428 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.19 
 
 
432 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.38 
 
 
426 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.62 
 
 
426 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.62 
 
 
429 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0806  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.81 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132549  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.62 
 
 
426 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.67 
 
 
426 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2572  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.66 
 
 
431 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.19 
 
 
426 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
425 aa  531  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.1 
 
 
428 aa  531  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.05 
 
 
433 aa  527  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.95 
 
 
441 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3303  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.38 
 
 
430 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.12 
 
 
429 aa  521  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2901  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.38 
 
 
430 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0920757  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3902  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.81 
 
 
427 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.65 
 
 
425 aa  519  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.76 
 
 
427 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.06 
 
 
429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.76 
 
 
444 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
442 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000011434 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0113  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.75 
 
 
435 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.76 
 
 
444 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.04 
 
 
427 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2085  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.75 
 
 
435 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.58 
 
 
428 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.76 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.13 
 
 
431 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.96 
 
 
430 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3683  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.71 
 
 
427 aa  504  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3024  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.43 
 
 
437 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0161  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.37 
 
 
433 aa  504  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.9 
 
 
433 aa  504  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.73 
 
 
430 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.18 
 
 
426 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2625  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.66 
 
 
429 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.29 
 
 
427 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3357  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.82 
 
 
442 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>