More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0666 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
433 aa  871    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0923  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.64 
 
 
427 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477129  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0831  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.64 
 
 
427 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  75.52 
 
 
427 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2625  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  81.54 
 
 
429 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0558  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  92.38 
 
 
433 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.655288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4065  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.64 
 
 
427 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2436  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.64 
 
 
427 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0610  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  92.61 
 
 
433 aa  818    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  75.06 
 
 
427 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  82.54 
 
 
430 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0482  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.4 
 
 
427 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0822  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.64 
 
 
427 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  77.4 
 
 
427 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0261  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  68.13 
 
 
433 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  68.37 
 
 
434 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  74.76 
 
 
426 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1543  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.9 
 
 
427 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2142  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.67 
 
 
427 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2601  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.67 
 
 
427 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3099  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.67 
 
 
569 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.43 
 
 
480 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3064  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.43 
 
 
427 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.67 
 
 
514 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0768  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  76.67 
 
 
502 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.14 
 
 
425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.13 
 
 
428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  66.9 
 
 
425 aa  568  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3683  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  67.61 
 
 
427 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.87 
 
 
428 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.49 
 
 
437 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3357  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.88 
 
 
442 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249572  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.26 
 
 
427 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3902  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64.57 
 
 
427 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1133  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.88 
 
 
442 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0808727  normal  0.150983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  64.71 
 
 
436 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108936  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  64.71 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  62.56 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.33 
 
 
427 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.33 
 
 
427 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1569  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.11 
 
 
438 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0898  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.04 
 
 
437 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3024  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.65 
 
 
437 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.09 
 
 
427 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.74 
 
 
431 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.48 
 
 
429 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.76 
 
 
427 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.38 
 
 
425 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  61.63 
 
 
426 aa  531  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.02 
 
 
428 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.42 
 
 
427 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.25 
 
 
429 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  62.53 
 
 
429 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.02 
 
 
428 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.93 
 
 
427 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.25 
 
 
428 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.91 
 
 
432 aa  525  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.7 
 
 
427 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.28 
 
 
431 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2904  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.57 
 
 
434 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.47 
 
 
426 aa  522  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.7 
 
 
427 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.91 
 
 
430 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.19 
 
 
432 aa  518  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.67 
 
 
430 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.93 
 
 
428 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.78 
 
 
427 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.53 
 
 
426 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3581  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.34 
 
 
434 aa  521  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103702 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02277  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.14 
 
 
441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.18 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.55 
 
 
430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.14 
 
 
430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.67 
 
 
430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0600  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  61.27 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.44 
 
 
444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.67 
 
 
430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0806  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  63.02 
 
 
429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132549  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.67 
 
 
444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.48 
 
 
445 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.51 
 
 
433 aa  511  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.98 
 
 
431 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.55 
 
 
430 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.31 
 
 
430 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.31 
 
 
430 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2572  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.84 
 
 
431 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.61 
 
 
438 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
426 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
426 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
426 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.89 
 
 
426 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  58.12 
 
 
426 aa  508  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
426 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
426 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  59.95 
 
 
426 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.72 
 
 
426 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
426 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.95 
 
 
426 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59.72 
 
 
426 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.7 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>