More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5548 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  97.61 
 
 
460 aa  846    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  100 
 
 
460 aa  934    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  100 
 
 
460 aa  934    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  68.39 
 
 
487 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  68.39 
 
 
452 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  68.39 
 
 
499 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  68.16 
 
 
452 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  68.16 
 
 
487 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  68.16 
 
 
452 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  69.58 
 
 
426 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  67.56 
 
 
452 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  68.16 
 
 
452 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  67.04 
 
 
452 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  69.96 
 
 
454 aa  594  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  67.56 
 
 
452 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  69.34 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  56.83 
 
 
464 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  58.01 
 
 
450 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  55.9 
 
 
462 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  55.53 
 
 
463 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  52.64 
 
 
463 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  55.14 
 
 
457 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  54.92 
 
 
457 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  54.92 
 
 
455 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  51.79 
 
 
457 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  52.35 
 
 
459 aa  455  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  52.9 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  51.66 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  55.29 
 
 
447 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  50.56 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  48.16 
 
 
451 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  49.32 
 
 
461 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  49.89 
 
 
462 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  35.42 
 
 
457 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  34.04 
 
 
473 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  29.14 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.34 
 
 
456 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.99 
 
 
430 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.05 
 
 
429 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.05 
 
 
428 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.05 
 
 
429 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.05 
 
 
429 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.79 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.79 
 
 
429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.43 
 
 
428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.43 
 
 
428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.79 
 
 
429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.85 
 
 
427 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.79 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.79 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.79 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.68 
 
 
432 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30 
 
 
429 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.26 
 
 
429 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.85 
 
 
427 aa  160  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3859  aminotransferase class-III  26.93 
 
 
449 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.88 
 
 
433 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1791  aminotransferase class-III  29.05 
 
 
466 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0602561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.02 
 
 
445 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.61 
 
 
427 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.79 
 
 
434 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.69 
 
 
430 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.85 
 
 
431 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.39 
 
 
430 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.69 
 
 
430 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.69 
 
 
429 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.18 
 
 
438 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.88 
 
 
428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.88 
 
 
428 aa  156  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.69 
 
 
430 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.02 
 
 
432 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.48 
 
 
431 aa  156  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3024  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.42 
 
 
437 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1942  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.14 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.831095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.52 
 
 
425 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.5 
 
 
432 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0898  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.8 
 
 
437 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.04 
 
 
432 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30 
 
 
431 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.07 
 
 
428 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.71 
 
 
438 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0982  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.11 
 
 
415 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.272083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2904  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.06 
 
 
434 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2502  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
425 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.55 
 
 
437 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0847  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.93 
 
 
428 aa  150  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00900779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.76 
 
 
430 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3581  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.06 
 
 
434 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.29 
 
 
418 aa  150  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.26 
 
 
417 aa  150  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.76 
 
 
452 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.61 
 
 
431 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3086  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.46 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1467  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.81 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1109  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.65 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0827  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.41 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.215136  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.25 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0093  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.46 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>