More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1983 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1983  aminotransferase  100 
 
 		 451 aa  886    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2410  aminotransferase class-III  50.11 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4524  aminotransferase  48.76 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0157  aminotransferase class-III  49.44 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3921  aminotransferase  52.13 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1482  aminotransferase  45.82 
 
 		 463 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6324  aminotransferase  48.76 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72870  aminotransferase  48.87 
 
 		 450 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2718  aminotransferase  48.54 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650345  normal  0.579601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5454  aminotransferase  47.2 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292472 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2934  aminotransferase  46.77 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3060  aminotransferase  46.77 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1272  aminotransferase  46.77 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1290  aminotransferase  46.77 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0060  aminotransferase  48.6 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2247  aminotransferase  46.77 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0985  aminotransferase  46.77 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901398  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1966  aminotransferase  47.29 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3220  aminotransferase  46.41 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4906  aminotransferase  48.13 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6418  aminotransferase  47.99 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2249  aminotransferase  47.33 
 
 		 557 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3953  aminotransferase  46.54 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25217  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2005  aminotransferase  46.41 
 
 		 454 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.802074 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5548  aminotransferase  47.54 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5913  aminotransferase  47.54 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1569  aminotransferase  44.19 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0220  aminotransferase  44.19 
 
 		 457 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3050  aminotransferase  45.52 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2385  aminotransferase class-III  45.86 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1011  aminotransferase  45.68 
 
 		 462 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11030  aminotransferase  45.68 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1119  aminotransferase  39.95 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3778  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.55 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0949  aminotransferase class-III  33.84 
 
 		 473 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.762342  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1791  aminotransferase class-III  33.77 
 
 		 466 aa  206  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0602561  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3859  aminotransferase class-III  30 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.83 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1970  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.63 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.31 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.34 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.82 
 
 		 430 aa  163  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.42 
 
 		 429 aa  163  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.07 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.57 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.57 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.14 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.14 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.57 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.81 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.81 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.89 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.54 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2012  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.03 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.82 
 
 		 437 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.57 
 
 		 457 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  28.32 
 
 		 452 aa  156  9e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1467  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.25 
 
 		 446 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.95 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.15 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.92 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.69 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2109  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.336776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.87 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.83 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.42 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.17 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11660  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.51 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.545154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4475  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.74 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.03 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.33 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0042  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.14 
 
 		 430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.46 
 
 		 432 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.15 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0185  aminotransferase class-III  33.15 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.15 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.03 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.5 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.92 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.37 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.59 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.75 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0485  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.51 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2017  aminotransferase class-III  30.71 
 
 		 424 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2040  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.51 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.108556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.09 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0531  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.09 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.66 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.6 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0438  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.86 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.11 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.44 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.6 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.28 
 
 		 432 aa  150  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.27 
 
 		 427 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.95 
 
 		 430 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4790  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.86 
 
 		 434 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.302308  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2502  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.88 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  27.51 
 
 		 427 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0536  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.86 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>