More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1266 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4525  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  63.56 
 
 		 820 aa  1043    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.927735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0208  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  48.74 
 
 		 801 aa  774    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3774  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.74 
 
 		 813 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.541337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1407  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.2 
 
 		 815 aa  889    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2849  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.54 
 
 		 820 aa  882    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.94 
 
 		 801 aa  768    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0592  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  61.14 
 
 		 820 aa  1026    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  48.43 
 
 		 801 aa  762    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.68 
 
 		 801 aa  767    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.43 
 
 		 801 aa  762    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3130  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.25 
 
 		 814 aa  909    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23370  Assimilatory Nitrite reductase,large subunit; NasA  56.39 
 
 		 816 aa  874    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0816  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  56.72 
 
 		 814 aa  922    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359061  normal  0.0137371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1707  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  83.86 
 
 		 839 aa  1421    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2245  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.65 
 
 		 837 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.240706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2309  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  57.64 
 
 		 818 aa  926    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0719  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  60.07 
 
 		 820 aa  950    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.825422  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0741  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  58.31 
 
 		 814 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1114  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.59 
 
 		 812 aa  990    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1781  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  54.51 
 
 		 823 aa  878    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2107  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  55.18 
 
 		 823 aa  860    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.614083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2096  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  55.99 
 
 		 818 aa  916    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3525  assimilatory nitrite reductase large subunit  54.12 
 
 		 816 aa  866    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  48.43 
 
 		 801 aa  762    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1490  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.25 
 
 		 814 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.93 
 
 		 801 aa  756    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0464  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  58.06 
 
 		 814 aa  907    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.31 
 
 		 801 aa  760    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1667  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  60.84 
 
 		 810 aa  974    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0751233  normal  0.158912 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2472  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  47 
 
 		 801 aa  756    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2593  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.94 
 
 		 825 aa  844    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2968  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  80.54 
 
 		 831 aa  1348    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  57.87 
 
 		 811 aa  920    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2557  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  56.82 
 
 		 823 aa  895    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.68 
 
 		 808 aa  817    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  54.07 
 
 		 821 aa  864    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3276  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  56.02 
 
 		 810 aa  881    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  61.77 
 
 		 815 aa  1029    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0573  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  58.19 
 
 		 814 aa  906    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3162  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.06 
 
 		 801 aa  760    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00213461  normal  0.298002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3528  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.54 
 
 		 820 aa  882    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2965  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  61.86 
 
 		 817 aa  1005    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.34 
 
 		 821 aa  866    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2424  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  47 
 
 		 801 aa  756    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2956  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  64.36 
 
 		 818 aa  1075    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1990  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  47.93 
 
 		 800 aa  760    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1266  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  100 
 
 		 825 aa  1681    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0963412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2317  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  55.96 
 
 		 819 aa  880    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.551763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1080  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  59.31 
 
 		 814 aa  973    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.406718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2839  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  56.47 
 
 		 821 aa  867    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.184658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1142  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.76 
 
 		 825 aa  903    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.861226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  61.61 
 
 		 814 aa  983    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.68 
 
 		 801 aa  766    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1000  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.35 
 
 		 816 aa  892    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1700  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  57.94 
 
 		 811 aa  951    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.575793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  61.48 
 
 		 826 aa  1011    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0397  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.82 
 
 		 834 aa  636    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  63.18 
 
 		 816 aa  1031    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116537  normal  0.910407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41530  assimilatory nitrite reductase large subunit  54.37 
 
 		 816 aa  871    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0558  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.49 
 
 		 814 aa  911    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1629  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  62.72 
 
 		 816 aa  1029    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.899619  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.6 
 
 		 810 aa  963    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2919  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.25 
 
 		 814 aa  909    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0099  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.25 
 
 		 814 aa  909    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3053  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.5 
 
 		 827 aa  634  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.050716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.57 
 
 		 822 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742948  normal  0.535106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3242  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.92 
 
 		 819 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3231  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  45.04 
 
 		 819 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3013  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.14 
 
 		 823 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3293  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.04 
 
 		 819 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3275  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.42 
 
 		 846 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.77 
 
 		 870 aa  610  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1392  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.67 
 
 		 839 aa  608  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2384  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.95 
 
 		 830 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312411  normal  0.440122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  36.62 
 
 		 837 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05591  nitrate reductase  37.67 
 
 		 839 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  37.8 
 
 		 971 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.69 
 
 		 1373 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2176  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  41.38 
 
 		 833 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000870313  hitchhiker  0.00000985708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3956  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.2 
 
 		 848 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0235  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.2 
 
 		 848 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5406  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.33 
 
 		 837 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4860  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  38.5 
 
 		 853 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0178  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.61 
 
 		 844 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2730  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.89 
 
 		 1396 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4046  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.47 
 
 		 850 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1441  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.35 
 
 		 1386 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1744  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.59 
 
 		 853 aa  487  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1875  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.96 
 
 		 880 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.654316  hitchhiker  0.000051224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5924  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  40.18 
 
 		 814 aa  485  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0194616  normal  0.0886236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1544  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.22 
 
 		 1396 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.673057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  34.94 
 
 		 850 aa  482  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2355  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  36.7 
 
 		 851 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000467029  normal  0.479007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3561  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.7 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03216  nitrite reductase, large subunit, NAD(P)H-binding  35.7 
 
 		 847 aa  479  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.7 
 
 		 847 aa  479  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03164  flavoprotein FAD oxidoreductase  61.25 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229065  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3647  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.7 
 
 		 847 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3835  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.7 
 
 		 847 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.7 
 
 		 847 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>