More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3494 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_23370  Assimilatory Nitrite reductase,large subunit; NasA  46.81 
 
 
816 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3528  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.2 
 
 
820 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3242  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  85.15 
 
 
819 aa  1411    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3013  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  92.36 
 
 
823 aa  1517    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  65.26 
 
 
870 aa  1095    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0397  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  68.04 
 
 
834 aa  1116    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17666  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3130  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.05 
 
 
814 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1392  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  65.02 
 
 
839 aa  1055    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0816  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  45.17 
 
 
814 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359061  normal  0.0137371 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0573  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.05 
 
 
814 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2309  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  46.67 
 
 
818 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0741  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.17 
 
 
814 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.63 
 
 
801 aa  639    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1781  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  44.93 
 
 
823 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3774  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.77 
 
 
813 aa  1031    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.541337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2245  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  69.29 
 
 
837 aa  1196    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.240706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.99 
 
 
821 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1707  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  46 
 
 
839 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0464  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.42 
 
 
814 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2849  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.2 
 
 
820 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2968  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  45.97 
 
 
831 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2557  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  44.92 
 
 
823 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3276  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  46.22 
 
 
810 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464677  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3053  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  66.83 
 
 
827 aa  1098    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.050716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2317  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  45.44 
 
 
819 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.551763  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  47.46 
 
 
808 aa  679    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3525  assimilatory nitrite reductase large subunit  46.68 
 
 
816 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3231  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  85.4 
 
 
819 aa  1413    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0099  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.05 
 
 
814 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1700  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  46.03 
 
 
811 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.575793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41530  assimilatory nitrite reductase large subunit  46.37 
 
 
816 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2919  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.05 
 
 
814 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3275  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  68.86 
 
 
846 aa  1151    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1490  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.05 
 
 
814 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0558  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  46.17 
 
 
814 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2096  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  46.52 
 
 
818 aa  656    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115121 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3293  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  85.4 
 
 
819 aa  1413    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  100 
 
 
822 aa  1665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742948  normal  0.535106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0592  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  44.85 
 
 
820 aa  635  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.26 
 
 
801 aa  632  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.26 
 
 
801 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.38 
 
 
801 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.26 
 
 
801 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2839  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  45.55 
 
 
821 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.184658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.6 
 
 
826 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3162  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.18 
 
 
801 aa  632  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00213461  normal  0.298002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  42.13 
 
 
801 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0208  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43 
 
 
801 aa  630  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  42.13 
 
 
801 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1407  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.23 
 
 
815 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2956  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.13 
 
 
818 aa  631  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.43 
 
 
821 aa  631  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1000  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.16 
 
 
816 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2107  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  45.48 
 
 
823 aa  625  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.614083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1990  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  41.39 
 
 
800 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2593  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.99 
 
 
825 aa  618  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2965  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  43.81 
 
 
817 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1266  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  43.62 
 
 
825 aa  616  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0963412  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  43.81 
 
 
815 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1142  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.63 
 
 
825 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.861226  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4525  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.69 
 
 
820 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.927735  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1629  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.42 
 
 
816 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.899619  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2472  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.62 
 
 
801 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.54 
 
 
816 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116537  normal  0.910407 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2424  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.62 
 
 
801 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1114  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.12 
 
 
812 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1667  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  44.95 
 
 
810 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0751233  normal  0.158912 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  40.18 
 
 
801 aa  595  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  42.54 
 
 
811 aa  582  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1080  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.19 
 
 
814 aa  581  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.406718  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.19 
 
 
810 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0719  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  43.78 
 
 
820 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.825422  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.72 
 
 
814 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.78 
 
 
1373 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2322  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor / assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit / assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  40.29 
 
 
1328 aa  528  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286672  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4164  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.15 
 
 
851 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4276  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.15 
 
 
851 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160671  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2730  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.68 
 
 
1396 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4860  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  39.76 
 
 
853 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1441  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.58 
 
 
1386 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1544  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.44 
 
 
1396 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.673057  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1222  nitrite reductase NADPH large subunit  40.51 
 
 
852 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356268  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05591  nitrate reductase  37.04 
 
 
839 aa  502  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2815  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.4 
 
 
852 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.487055  normal  0.890112 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  36.71 
 
 
971 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0319  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  38.38 
 
 
854 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5659  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.03 
 
 
854 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.150409  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.26 
 
 
837 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4818  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H-binding) large subunit precursor  38.49 
 
 
853 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1875  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.22 
 
 
880 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.654316  hitchhiker  0.000051224 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0245  nitrite reductase large subunit  37.58 
 
 
858 aa  485  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0178  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.64 
 
 
844 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.76 
 
 
837 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2355  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  36.87 
 
 
851 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000467029  normal  0.479007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.91 
 
 
1381 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  36.78 
 
 
837 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5406  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.23 
 
 
837 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2214  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  39.04 
 
 
862 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0126186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1811  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.05 
 
 
889 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.603082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0172  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.21 
 
 
837 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>