More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1080 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2472  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.7 
 
 
801 aa  710    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0099  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.03 
 
 
814 aa  897    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2919  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.03 
 
 
814 aa  897    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2839  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  52.87 
 
 
821 aa  827    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.184658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.41 
 
 
821 aa  845    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2317  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  52.76 
 
 
819 aa  835    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.551763  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.39 
 
 
801 aa  701    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0592  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.53 
 
 
820 aa  930    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3528  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.29 
 
 
820 aa  848    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.91 
 
 
826 aa  944    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2956  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  61.88 
 
 
818 aa  1025    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  73.37 
 
 
815 aa  1259    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  45.31 
 
 
801 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.44 
 
 
801 aa  691    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.31 
 
 
801 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3130  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.03 
 
 
814 aa  897    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  74.11 
 
 
816 aa  1260    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116537  normal  0.910407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0816  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  53.47 
 
 
814 aa  865    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359061  normal  0.0137371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2309  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  53.82 
 
 
818 aa  862    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0719  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  74.42 
 
 
820 aa  1231    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.825422  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0741  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.91 
 
 
814 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1781  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  52.2 
 
 
823 aa  840    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.75 
 
 
821 aa  825    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.31 
 
 
801 aa  689    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2593  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  51.41 
 
 
825 aa  810    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3525  assimilatory nitrite reductase large subunit  52.26 
 
 
816 aa  843    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2849  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.29 
 
 
820 aa  848    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  45.31 
 
 
801 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3162  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.58 
 
 
801 aa  694    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00213461  normal  0.298002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0464  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.67 
 
 
814 aa  892    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1990  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.68 
 
 
800 aa  680    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4525  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  75.12 
 
 
820 aa  1270    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.927735  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2968  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  58.1 
 
 
831 aa  954    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1407  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.46 
 
 
815 aa  832    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  64.5 
 
 
811 aa  1080    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2557  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  53.32 
 
 
823 aa  847    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1707  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  60.17 
 
 
839 aa  992    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3276  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  54.34 
 
 
810 aa  828    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464677  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1114  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  54.74 
 
 
812 aa  897    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2107  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  53.14 
 
 
823 aa  836    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.614083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1667  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  67.77 
 
 
810 aa  1140    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0751233  normal  0.158912 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1490  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.03 
 
 
814 aa  897    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2965  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  56.24 
 
 
817 aa  916    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  48.89 
 
 
808 aa  758    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2424  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.7 
 
 
801 aa  710    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1266  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  58.56 
 
 
825 aa  946    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0963412  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0208  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.62 
 
 
801 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  75.28 
 
 
814 aa  1253    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1000  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.15 
 
 
816 aa  842    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1700  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  53.7 
 
 
811 aa  898    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.575793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23370  Assimilatory Nitrite reductase,large subunit; NasA  52.21 
 
 
816 aa  820    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41530  assimilatory nitrite reductase large subunit  52.75 
 
 
816 aa  850    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1629  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  73.62 
 
 
816 aa  1256    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.899619  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0558  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.03 
 
 
814 aa  899    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  43.54 
 
 
801 aa  687    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0573  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  55.79 
 
 
814 aa  893    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1142  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  51.22 
 
 
825 aa  831    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.861226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  66.46 
 
 
810 aa  1099    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2096  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  52.5 
 
 
818 aa  847    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1080  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  100 
 
 
814 aa  1664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.406718  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.44 
 
 
801 aa  689    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2245  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.61 
 
 
837 aa  622  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.240706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.28 
 
 
870 aa  614  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0397  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.1 
 
 
834 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17666  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3053  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42.36 
 
 
827 aa  590  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.050716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1392  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  41.9 
 
 
839 aa  582  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.19 
 
 
822 aa  581  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742948  normal  0.535106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3275  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42.1 
 
 
846 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3231  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  42.21 
 
 
819 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3293  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42.21 
 
 
819 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3242  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42.09 
 
 
819 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838736  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3774  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.02 
 
 
813 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.541337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3013  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42.28 
 
 
823 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0235  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.62 
 
 
848 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3956  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  36.62 
 
 
848 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  34.96 
 
 
971 aa  466  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4860  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.24 
 
 
853 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  36.09 
 
 
837 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0178  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.34 
 
 
844 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5659  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.36 
 
 
854 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.150409  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.35 
 
 
850 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3671  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.97 
 
 
847 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.35 
 
 
1373 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3842  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
847 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294363  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4276  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.36 
 
 
851 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160671  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1441  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.29 
 
 
1386 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4164  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.36 
 
 
851 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5924  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.14 
 
 
814 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0194616  normal  0.0886236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3744  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
847 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.23042  normal  0.171499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3779  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  35.72 
 
 
847 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4046  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.35 
 
 
850 aa  452  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3671  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
847 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.6 
 
 
847 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3647  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.72 
 
 
847 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3561  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.6 
 
 
847 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.72 
 
 
847 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3741  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.72 
 
 
847 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2322  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor / assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit / assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  36.5 
 
 
1328 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286672  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3835  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.72 
 
 
847 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4676  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.72 
 
 
847 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.54103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>