37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2587 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  100 
 
 		 452 aa  886    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  27.83 
 
 		 445 aa  169  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  24.4 
 
 		 439 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  29.95 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  30.96 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  25.51 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  22.51 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  23.92 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3246  fucose isomerase domain-containing protein  22.06 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0905  fucose isomerase domain-containing protein  22.06 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3380  L-fucose isomerase-like protein  22.06 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2128  L-fucose isomerase-like protein  21.79 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0200  L-fucose isomerase related protein  24.29 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  20.27 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  21.41 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  23.98 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  21.89 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  27.27 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1733  L-fucose isomerase related protein  21.8 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501597  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  21.11 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  25.08 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0624  L-fucose isomerase 1 domain-containing protein  22.14 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  22.19 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  22.1 
 
 		 478 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  25.08 
 
 		 477 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  19.59 
 
 		 499 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0610  L-fucose isomerase N-terminal_2 domain-containing protein  21.12 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.194613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3469  L-fucose isomerase-like protein  23.37 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000257161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  20.65 
 
 		 493 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  24.23 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  26.65 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3985  L-fucose isomerase _2 domain protein  27.37 
 
 		 471 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1608  L-fucose isomerase-like protein  23.51 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0707  L-fucose isomerase-like protein  21 
 
 		 494 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2897  L-arabinose isomerase  23.55 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  26.32 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3126  L-fucose isomerase 2 domain-containing protein  24.76 
 
 		 470 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0115763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>