40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4813 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  100 
 
 		 477 aa  965    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  59.49 
 
 		 470 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  48.72 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  47.87 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  43.06 
 
 		 493 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  43.61 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  44.21 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  46.91 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  41.91 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  43.8 
 
 		 475 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  43.12 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  40.72 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  27.1 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  25.76 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  23.03 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  20.9 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  25.37 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  25.31 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  26.2 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  25.67 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  24.37 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  23.14 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2734  L-arabinose isomerase  22.44 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6217  L-arabinose isomerase  25.99 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  24.46 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  18.53 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  21.05 
 
 		 496 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06960  L-arabinose isomerase  24.41 
 
 		 502 aa  50.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2243  L-arabinose isomerase  22.3 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000390243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0244  L-arabinose isomerase  24.94 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0498  L-arabinose isomerase  22.57 
 
 		 502 aa  47.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.730829  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2897  L-arabinose isomerase  22.3 
 
 		 494 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4713  L-arabinose isomerase  24.57 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29550  L-arabinose isomerase  23.77 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2753  L-arabinose isomerase  24.39 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0767064  decreased coverage  0.00000377093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0326  L-arabinose isomerase  20.4 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0381  L-arabinose isomerase  25.81 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2001  L-arabinose isomerase  21.39 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1887  L-arabinose isomerase  21.39 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2259  L-arabinose isomerase  21.39 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>