62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2038 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  100 
 
 		 470 aa  969    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  59.49 
 
 		 477 aa  547  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  49.04 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  48.51 
 
 		 478 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  47.02 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  47.05 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  47.33 
 
 		 478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  47.67 
 
 		 475 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  45.45 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  46.06 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  47.05 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  39.54 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  29.06 
 
 		 478 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  26.02 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  21.99 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  26.39 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  25.51 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  23.47 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2897  L-arabinose isomerase  22.79 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  21.07 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  23.72 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2731  L-arabinose isomerase  25.99 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.746734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3996  L-arabinose isomerase  22.2 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0451143  normal  0.502282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0326  L-arabinose isomerase  23.13 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3664  L-arabinose isomerase  24.03 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6217  L-arabinose isomerase  23.67 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0498  L-arabinose isomerase  21.57 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.730829  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0774  L-arabinose isomerase  22.14 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.031491  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  22.78 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29550  L-arabinose isomerase  22.3 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  21.14 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0609  L-arabinose isomerase  23.17 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal  0.159934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  23.06 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2066  L-arabinose isomerase  22.64 
 
 		 505 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000180583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2243  L-arabinose isomerase  23.08 
 
 		 501 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000390243 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2140  L-arabinose isomerase  21.71 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.47731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2001  L-arabinose isomerase  21.56 
 
 		 500 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1887  L-arabinose isomerase  21.56 
 
 		 500 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3272  L-arabinose isomerase  24.35 
 
 		 515 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06960  L-arabinose isomerase  23.54 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3203  L-arabinose isomerase  23.12 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  21.49 
 
 		 467 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1238  L-arabinose isomerase  21.9 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2753  L-arabinose isomerase  23.19 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0767064  decreased coverage  0.00000377093 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2259  L-arabinose isomerase  21.3 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1382  L-arabinose isomerase  22.93 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4713  L-arabinose isomerase  22.25 
 
 		 497 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2151  L-arabinose isomerase  22.76 
 
 		 503 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0381  L-arabinose isomerase  23.77 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2066  L-arabinose isomerase  23.21 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205701  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0672  L-arabinose isomerase  21.34 
 
 		 496 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0648  L-arabinose isomerase  21.34 
 
 		 496 aa  50.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0388449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0224  L-arabinose isomerase  23.58 
 
 		 511 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1995  L-arabinose isomerase  23.21 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00575721  unclonable  0.000026783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1979  L-arabinose isomerase  23.21 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173872  normal  0.0652997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2327  L-arabinose isomerase  21.19 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.305098  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  22.93 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2027  L-arabinose isomerase  21.13 
 
 		 501 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.929629  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1914  L-arabinose isomerase  21.71 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1121  L-arabinose isomerase  21.07 
 
 		 502 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0624  L-fucose isomerase 1 domain-containing protein  26.97 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0610  L-fucose isomerase N-terminal_2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.194613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>