49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3280 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  100 
 
 		 478 aa  961    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  70.43 
 
 		 475 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  62.72 
 
 		 476 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  48.51 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  47.87 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  42.77 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  42.6 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  42.55 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  42.8 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  41.26 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  39.79 
 
 		 499 aa  359  8e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  35.76 
 
 		 498 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  27.51 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  21.38 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  24.94 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  24.94 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  22.89 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  24.88 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4713  L-arabinose isomerase  23.79 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  22.1 
 
 		 452 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2001  L-arabinose isomerase  22.56 
 
 		 500 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1887  L-arabinose isomerase  22.56 
 
 		 500 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2259  L-arabinose isomerase  22.56 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3203  L-arabinose isomerase  21.96 
 
 		 497 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  20.91 
 
 		 496 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2897  L-arabinose isomerase  21.62 
 
 		 494 aa  53.5  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6217  L-arabinose isomerase  23.68 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29550  L-arabinose isomerase  21.58 
 
 		 502 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2327  L-arabinose isomerase  21.26 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.305098  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  22.02 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2027  L-arabinose isomerase  21.26 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.929629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0381  L-arabinose isomerase  21.2 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0326  L-arabinose isomerase  21.13 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2734  L-arabinose isomerase  21.38 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  23.35 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2151  L-arabinose isomerase  21.36 
 
 		 503 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0224  L-arabinose isomerase  21.16 
 
 		 511 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2753  L-arabinose isomerase  21.9 
 
 		 502 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0767064  decreased coverage  0.00000377093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0054  L-arabinose isomerase  20.76 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2243  L-arabinose isomerase  21.5 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000390243 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0498  L-arabinose isomerase  19.51 
 
 		 502 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.730829  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0106  L-arabinose isomerase  20.24 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00063  hypothetical protein  20.76 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0066  L-arabinose isomerase  20.76 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0064  L-arabinose isomerase  20.76 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0849875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00064  L-arabinose isomerase  20.76 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0064  L-arabinose isomerase  20.76 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203815  normal  0.780498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3595  L-arabinose isomerase  20.76 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0067  L-arabinose isomerase  20.76 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>