46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2628 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  100 
 
 		 445 aa  910    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  27.83 
 
 		 452 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  28.46 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3246  fucose isomerase domain-containing protein  27.23 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3380  L-fucose isomerase-like protein  27.23 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0905  fucose isomerase domain-containing protein  27.23 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  26.62 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2128  L-fucose isomerase-like protein  25.67 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  26.43 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  28.72 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1608  L-fucose isomerase-like protein  29.47 
 
 		 471 aa  96.3  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0610  L-fucose isomerase N-terminal_2 domain-containing protein  25.41 
 
 		 473 aa  93.2  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.194613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0624  L-fucose isomerase 1 domain-containing protein  25.14 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  25.98 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  26.6 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1733  L-fucose isomerase related protein  24.19 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  22.79 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0200  L-fucose isomerase related protein  24.11 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  22.85 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  22.89 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0707  L-fucose isomerase-like protein  22.82 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3126  L-fucose isomerase 2 domain-containing protein  23.97 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0115763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  21.59 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0329  hypothetical protein  26.77 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  22.17 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  21.07 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0832  L-fucose isomerase  22.7 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0071314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  22.93 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0229  hypothetical protein  23.53 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.745759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0267  hypothetical protein  23.57 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0597418  hitchhiker  0.000000218565 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  22.36 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3469  L-fucose isomerase-like protein  23.56 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000257161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3985  L-fucose isomerase _2 domain protein  23.81 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  21.04 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  22 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1320  hypothetical protein  28.67 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0743  hypothetical protein  24.77 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000046156 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0227  hypothetical protein  30.07 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  20.39 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  20.6 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  18.93 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0212  hypothetical protein  28.47 
 
 		 362 aa  46.6  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.931385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1032  hypothetical protein  23.51 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.775746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1106  L-fucose isomerase and related protein-like protein  22.63 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.818245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1559  L-fucose isomerase and related proteins-like  36.49 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  20.04 
 
 		 501 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>