58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3616 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  100 
 
 		 476 aa  938    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  62.72 
 
 		 478 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  60.42 
 
 		 475 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  47.16 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  46.82 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  39.78 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  40 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  38.59 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  40.53 
 
 		 475 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  37.89 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  34.85 
 
 		 499 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  30.49 
 
 		 498 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  27.21 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  21.08 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  25 
 
 		 452 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  22.17 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  27.27 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  22.7 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  25.5 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  24.03 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  27.11 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  24.71 
 
 		 501 aa  57  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2327  L-arabinose isomerase  24.08 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.305098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3537  L-arabinose isomerase  23.36 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0067  L-arabinose isomerase  23.36 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00064  L-arabinose isomerase  23.08 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0066  L-arabinose isomerase  23.08 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0064  L-arabinose isomerase  23.08 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0849875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3595  L-arabinose isomerase  23.08 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00063  hypothetical protein  23.08 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0064  L-arabinose isomerase  23.08 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203815  normal  0.780498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0113  L-arabinose isomerase  23.37 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0106  L-arabinose isomerase  23.67 
 
 		 500 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0109  L-arabinose isomerase  23.37 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309204 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0108  L-arabinose isomerase  23.37 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0609  L-arabinose isomerase  25.51 
 
 		 500 aa  53.9  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal  0.159934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0054  L-arabinose isomerase  25.09 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2027  L-arabinose isomerase  27.93 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.929629  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0113  L-arabinose isomerase  23.08 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2001  L-arabinose isomerase  22.92 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1887  L-arabinose isomerase  22.92 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0498  L-arabinose isomerase  21.51 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.730829  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2151  L-arabinose isomerase  26.73 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29550  L-arabinose isomerase  24.16 
 
 		 502 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2259  L-arabinose isomerase  24.19 
 
 		 500 aa  50.4  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6217  L-arabinose isomerase  27.76 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4713  L-arabinose isomerase  26.93 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2066  L-arabinose isomerase  21.73 
 
 		 505 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000180583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1238  L-arabinose isomerase  22.86 
 
 		 496 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2140  L-arabinose isomerase  21.16 
 
 		 500 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.47731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1995  L-arabinose isomerase  24.5 
 
 		 500 aa  47  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00575721  unclonable  0.000026783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1979  L-arabinose isomerase  24.5 
 
 		 500 aa  47  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173872  normal  0.0652997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06960  L-arabinose isomerase  23.53 
 
 		 502 aa  46.6  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1914  L-arabinose isomerase  25.93 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0224  L-arabinose isomerase  22.06 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2243  L-arabinose isomerase  23.96 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000390243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2066  L-arabinose isomerase  24 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205701  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1382  L-arabinose isomerase  24.23 
 
 		 504 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.788134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>