26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6090 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  73.83 
 
 		 541 aa  733    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  68.49 
 
 		 499 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  65.05 
 
 		 493 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  69.21 
 
 		 478 aa  689    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  100 
 
 		 475 aa  976    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  47.67 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  43.8 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  42.8 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  41.15 
 
 		 475 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  40.53 
 
 		 476 aa  339  8e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  38.7 
 
 		 499 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  37.92 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  26.78 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  26.12 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  24.47 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  22.36 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  21.89 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  21.15 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2066  L-arabinose isomerase  23.42 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205701  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1995  L-arabinose isomerase  23.14 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00575721  unclonable  0.000026783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1979  L-arabinose isomerase  23.14 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173872  normal  0.0652997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2066  L-arabinose isomerase  21.91 
 
 		 505 aa  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000180583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2734  L-arabinose isomerase  21.62 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3996  L-arabinose isomerase  25.97 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0451143  normal  0.502282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0054  L-arabinose isomerase  19.31 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  22.88 
 
 		 501 aa  43.5  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>