43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3096 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  67.52 
 
 		 478 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  100 
 
 		 541 aa  1106    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  73.83 
 
 		 475 aa  733    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  61.68 
 
 		 493 aa  646    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  65.76 
 
 		 499 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  46.06 
 
 		 470 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  43.12 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  41.26 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  40.33 
 
 		 475 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  38.09 
 
 		 476 aa  321  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  37.47 
 
 		 499 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  36.25 
 
 		 498 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  26.57 
 
 		 478 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  23.24 
 
 		 465 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  25 
 
 		 452 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  22.99 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  21.11 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  21.88 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2066  L-arabinose isomerase  21.15 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205701  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1995  L-arabinose isomerase  20.91 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00575721  unclonable  0.000026783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1979  L-arabinose isomerase  20.91 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173872  normal  0.0652997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2897  L-arabinose isomerase  22 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2066  L-arabinose isomerase  21.9 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000180583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3203  L-arabinose isomerase  21.15 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0054  L-arabinose isomerase  21.04 
 
 		 500 aa  47.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3996  L-arabinose isomerase  27.66 
 
 		 501 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0451143  normal  0.502282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0106  L-arabinose isomerase  21.23 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2734  L-arabinose isomerase  21.65 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0113  L-arabinose isomerase  20.92 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  21.68 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2140  L-arabinose isomerase  21.14 
 
 		 500 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.47731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0067  L-arabinose isomerase  20.73 
 
 		 500 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3537  L-arabinose isomerase  20.73 
 
 		 500 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00063  hypothetical protein  20.73 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00064  L-arabinose isomerase  20.73 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0064  L-arabinose isomerase  20.73 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203815  normal  0.780498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3595  L-arabinose isomerase  20.73 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0064  L-arabinose isomerase  20.73 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0849875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0066  L-arabinose isomerase  20.73 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0609  L-arabinose isomerase  21.41 
 
 		 500 aa  44.3  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal  0.159934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0113  L-arabinose isomerase  20.92 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0108  L-arabinose isomerase  20.92 
 
 		 500 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0109  L-arabinose isomerase  20.92 
 
 		 500 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>