78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0751 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  100 
 
 		 478 aa  956    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  67.92 
 
 		 452 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  40.86 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2243  L-arabinose isomerase  31.2 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000390243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  33.19 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0609  L-arabinose isomerase  31.76 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal  0.159934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1887  L-arabinose isomerase  29.73 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2001  L-arabinose isomerase  29.73 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0106  L-arabinose isomerase  31.27 
 
 		 500 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2259  L-arabinose isomerase  29.73 
 
 		 500 aa  163  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0109  L-arabinose isomerase  31.68 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309204 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0108  L-arabinose isomerase  31.68 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0113  L-arabinose isomerase  31.02 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0113  L-arabinose isomerase  31.68 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0067  L-arabinose isomerase  31.02 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0064  L-arabinose isomerase  31.02 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203815  normal  0.780498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3537  L-arabinose isomerase  31.19 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3595  L-arabinose isomerase  31.02 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00063  hypothetical protein  31.02 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0064  L-arabinose isomerase  31.02 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0849875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00064  L-arabinose isomerase  31.02 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0066  L-arabinose isomerase  31.02 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  30.39 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0054  L-arabinose isomerase  30.77 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2731  L-arabinose isomerase  31.2 
 
 		 496 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.746734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  29.06 
 
 		 470 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2734  L-arabinose isomerase  31.03 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0672  L-arabinose isomerase  29.58 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0648  L-arabinose isomerase  29.34 
 
 		 496 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0388449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3203  L-arabinose isomerase  28.99 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2027  L-arabinose isomerase  28.5 
 
 		 501 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.929629  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1238  L-arabinose isomerase  29.73 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06960  L-arabinose isomerase  30.81 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2897  L-arabinose isomerase  30.89 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1914  L-arabinose isomerase  30.2 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  30.47 
 
 		 502 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2327  L-arabinose isomerase  28.5 
 
 		 501 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.305098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3996  L-arabinose isomerase  30.43 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0451143  normal  0.502282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3272  L-arabinose isomerase  31.66 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6217  L-arabinose isomerase  31.17 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  28.4 
 
 		 496 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29550  L-arabinose isomerase  29.88 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2753  L-arabinose isomerase  29.83 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0767064  decreased coverage  0.00000377093 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0498  L-arabinose isomerase  29.83 
 
 		 502 aa  140  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.730829  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  25.99 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1382  L-arabinose isomerase  28.09 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1121  L-arabinose isomerase  28.64 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2066  L-arabinose isomerase  26.2 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205701  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4713  L-arabinose isomerase  32.43 
 
 		 497 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1995  L-arabinose isomerase  25.99 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00575721  unclonable  0.000026783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0774  L-arabinose isomerase  25.92 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.031491  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2151  L-arabinose isomerase  27.79 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1979  L-arabinose isomerase  25.99 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173872  normal  0.0652997 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0852  L-arabinose isomerase  29.14 
 
 		 474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  27.94 
 
 		 478 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3664  L-arabinose isomerase  30.12 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  24.22 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  26.78 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  28.07 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  26.17 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0244  L-arabinose isomerase  31.37 
 
 		 501 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  26.57 
 
 		 541 aa  130  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2066  L-arabinose isomerase  24.32 
 
 		 505 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000180583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0326  L-arabinose isomerase  27.88 
 
 		 500 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  28.12 
 
 		 501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0403  L-arabinose isomerase  29.1 
 
 		 503 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0224  L-arabinose isomerase  28.85 
 
 		 511 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  27.51 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2140  L-arabinose isomerase  25.8 
 
 		 500 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.47731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1018  L-arabinose isomerase  25.56 
 
 		 505 aa  123  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  27.21 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0381  L-arabinose isomerase  29.58 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  27.1 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0482  L-arabinose isomerase  26.74 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  22.02 
 
 		 499 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  21.59 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  25.21 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  26.32 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>